Saya mencoba menggunakan lme4::glmer()agar sesuai dengan model campuran binomial umum (GLMM) dengan variabel dependen yang bukan biner, tetapi variabel kontinu antara nol dan satu. Orang dapat menganggap variabel ini sebagai probabilitas; sebenarnya itu adalah probabilitas sebagaimana dilaporkan...
Saya bereksperimen dengan algoritma mesin peningkat gradien melalui caretpaket di R. Menggunakan dataset penerimaan perguruan tinggi kecil, saya menjalankan kode berikut: library(caret) ### Load admissions dataset. ### mydata <- read.csv("http://www.ats.ucla.edu/stat/data/binary.csv") ###...
Pertanyaan CV Saya mencoba memberikan (a) representasi matematis yang terperinci dan ringkas dari model efek campuran. Saya menggunakan lme4paket dalam R. Apa representasi matematika yang benar untuk model saya? Data, Pertanyaan Sains, dan Kode R Kumpulan data saya terdiri dari spesies di...
Dalam menentukan model efek campuran silang, saya mencoba memasukkan interaksi. Namun, saya mendapatkan pesan kesalahan berikut: Error in lme.formula(rate ~ nozzle, random = ~nozzle | operator, data = Flow) : nlminb problem, convergence error code = 1 message = iteration limit reached without...
Saya punya pertanyaan tentang penggunaan model campuran / lmer. Model dasarnya adalah ini: lmer(DV ~ group * condition + (1|pptid), data= df) Kelompok dan kondisi adalah kedua faktor: kelompok memiliki dua tingkat (groupA, groupB) dan kondisi memiliki tiga tingkat (kondisi1, kondisi2, kondisi3)....
Saya memiliki satu set data di mana variabel yang ingin saya gunakan sebagai efek acak hanya memiliki satu pengamatan untuk beberapa level. Berdasarkan jawaban atas pertanyaan sebelumnya, saya telah mengumpulkan bahwa, pada prinsipnya, ini baik-baik saja. Bisakah saya memasukkan model campuran...
Dapatkah seseorang tolong beri tahu saya bagaimana membuat R memperkirakan break point dalam model linear piecewise (sebagai parameter tetap atau acak), ketika saya juga perlu memperkirakan efek acak lainnya? Saya telah memasukkan contoh mainan di bawah ini yang cocok dengan tongkat hoki /...
Misalkan saya memiliki peserta, yang masing-masing memberikan respons 20 kali, 10 dalam satu kondisi dan 10 di lain. Saya cocok dengan model efek campuran linear yang membandingkan di setiap kondisi. Berikut adalah contoh yang dapat direplikasi mensimulasikan situasi ini menggunakan paket di...
Saya memiliki data pengukuran berulang yang tidak seimbang yang ditetapkan untuk dianalisis, dan saya telah membaca bahwa cara sebagian besar paket statistik menangani ini dengan ANOVA (yaitu tipe III jumlah kuadrat) salah. Oleh karena itu, saya ingin menggunakan model efek campuran untuk...
Saat ini saya sedang meninjau beberapa pekerjaan dan telah menemukan yang berikut, yang tampaknya salah bagi saya. Dua model campuran dipasang (dalam R) menggunakan lmer. Model tidak bersarang dan dibandingkan dengan uji rasio kemungkinan. Singkatnya, berikut adalah contoh yang dapat direproduksi...
Saya melakukan percobaan di mana saya membesarkan keluarga yang berbeda yang berasal dari dua populasi sumber yang berbeda. Setiap keluarga diberi satu dari dua perawatan. Setelah percobaan saya mengukur beberapa sifat pada setiap individu. Untuk menguji efek dari salah satu perlakuan atau sumber...
Misalkan saya memiliki beberapa beberapa variabel respon yang diukur dari th saudara di keluarga th. Selain itu, beberapa data perilaku dikumpulkan secara bersamaan dari masing-masing subjek. Saya mencoba menganalisis situasi dengan model efek campuran linier
Saya telah membaca tentang menghitung nilai dalam model campuran dan setelah membaca FAQ R-sig, posting lain di forum ini (saya akan menghubungkan beberapa tetapi saya tidak memiliki reputasi yang cukup) dan beberapa referensi lain yang saya pahami menggunakan dalam konteks model campuran rumit.R...
Saya merevisi makalah tentang penyerbukan, di mana data didistribusikan secara biner (buah matang atau tidak). Jadi saya menggunakan glmersatu efek acak (tanaman individu) dan satu efek tetap (pengobatan). Peninjau ingin tahu apakah tanaman berpengaruh pada set buah - tetapi saya mengalami...
Douglas Bates menyatakan bahwa model-model berikut ini setara "jika matriks varians-kovarians untuk efek acak bernilai vektor memiliki bentuk khusus, yang disebut simetri gabungan" ( slide 91 dalam presentasi ini ): m1 <- lmer(y ~ factor + (0 + factor|group), data) m2 <- lmer(y ~ factor +...
Saya menjalankan model regresi logistik dalam bentuk: lmer(response~1+(1|site), family=binomial, REML = FALSE) Biasanya saya akan menghitung ICC dari varian intersep dan residual, tetapi ringkasan model tidak termasuk varians residual. Bagaimana saya menghitung
Data saya dijelaskan di sini Apa yang dapat menyebabkan "Error () model singular error" di aov saat memasang ANOVA tindakan berulang? Saya mencoba untuk melihat efek dari interaksi menggunakan lmersehingga kasus dasar saya adalah: my_null.model <- lmer(value ~ Condition+Scenario+...
Saya memiliki model berikut: > model1<-lmer(aph.remain~sMFS1+sAG1+sSHDI1+sbare+season+crop +(1|landscape),family=poisson) ... dan ini adalah output ringkasan. > summary(model1) Generalized linear mixed model fit by the Laplace approximation Formula: aph.remain ~ sMFS1 + sAG1 + sSHDI1...
TL; DR: lme4optimasi tampaknya linier dalam jumlah parameter model secara default, dan jauh lebih lambat daripada glmmodel yang setara dengan variabel dummy untuk grup. Apakah ada yang bisa saya lakukan untuk mempercepatnya? Saya mencoba menyesuaikan model logit hierarkis yang cukup besar (~...
Saya mencoba menganalisis data tindakan berulang dan berusaha untuk membuatnya bekerja R. Data saya pada dasarnya adalah sebagai berikut, saya memiliki dua kelompok perlakuan. Setiap subjek dalam setiap kelompok diuji setiap hari dan diberi skor (persentase benar pada suatu tes). Data dalam format...