Saya mencoba menyesuaikan model campuran multivarian (yaitu, beberapa respons) di R. Selain dari paket ASReml-rdan SabreR(yang memerlukan perangkat lunak eksternal), sepertinya ini hanya mungkin di MCMCglmm. Dalam makalah yang menyertai MCMCglmmpaket (hal.6), Jarrod Hadfield menggambarkan proses...
Demi contoh sederhana berasumsi bahwa ada dua model regresi linier Model 1 memiliki tiga prediktor, x1a, x2b, danx2c Model 2 memiliki tiga prediktor dari model 1 dan dua prediktor tambahan x2adanx2b Ada persamaan regresi populasi di mana varians populasi yang dijelaskan adalah untuk Model 1 dan...
Saya menganalisis hasil percobaan waktu reaksi dalam R. Saya menjalankan pengukuran ANOVA berulang (1 faktor dalam subjek dengan 2 level dan 1 antara faktor subjek dengan 2 level). Saya menjalankan model campuran linear yang sama dan saya ingin meringkas hasil lmer dalam bentuk tabel ANOVA...
Bagaimana struktur varians-kovarians default untuk efek acak dalam glmeratau lmerdalam lme4paket? Bagaimana cara menentukan struktur varians-kovarians lain untuk efek-acak dalam kode? Saya tidak dapat menemukan informasi mengenai ini di
Saya mencoba menghitung prediksi efek acak dari model campuran linier dengan tangan, dan menggunakan notasi yang diberikan oleh Wood dalam Generalized Additive Models: sebuah pengantar dengan R (pg 294 / pg 307 pdf), saya semakin bingung mengenai apa yang masing-masing parameter mewakili. Di bawah...
Formula yang perlu ditentukan untuk pelatihan model bertingkat (menggunakan lmerdari lme4 Rperpustakaan) selalu membuat saya. Saya telah membaca banyak buku pelajaran dan tutorial, tetapi tidak pernah memahaminya dengan baik. Jadi, inilah contoh dari tutorial ini yang ingin saya lihat dirumuskan...
Saya menganalisa beberapa data perilaku menggunakan lme4di R, sebagian besar mengikuti tutorial Bodo Winter baik , tapi saya tidak mengerti jika saya menangani interaksi dengan benar. Lebih buruk lagi, tidak ada orang lain yang terlibat dalam penelitian ini menggunakan model campuran, jadi saya...
Saya mencoba mereproduksi beberapa uji interaksi antara keduanya lmdan lmerpada tindakan berulang (2x2x2). Alasan saya ingin membandingkan kedua metode ini adalah karena GLM SPSS untuk tindakan berulang menghasilkan hasil yang sama persis dengan lmpendekatan yang disajikan di sini, jadi pada...
Saya memiliki model berikut yang m_plotdilengkapi dengan lme4::lmerefek acak silang untuk peserta ( lfdn) dan item ( content): Random effects: Groups Name Variance Std.Dev. Corr lfdn (Intercept) 172.173 13.121 role1 62.351 7.896 0.03 inference1 24.640 4.964 0.08 -0.30 inference2 52.366...
Bagaimana saya bisa mendapatkan efek acak dikumpulkan untuk lmer setelah beberapa kali imputasi? Saya menggunakan mouse untuk menghubungkan beberapa frame data. Dan lme4 untuk model campuran dengan intersep acak dan kemiringan acak. Pooling lmer baik-baik saja, kecuali bahwa itu tidak mengumpulkan...
Diberikan tiga variabel, ydan x, yang positif kontinu, dan z, yang kategorikal, saya memiliki dua model kandidat yang diberikan oleh: fit.me <- lmer( y ~ 1 + x + ( 1 + x | factor(z) ) ) dan fit.fe <- lm( y ~ 1 + x ) Saya berharap untuk membandingkan model ini untuk menentukan model mana...
Saya melakukan tes post-hoc pada model efek campuran linear dalam R( lme4paket). Saya menggunakan multcomppaket ( glht()fungsi) untuk melakukan tes post-hoc. Desain eksperimental saya adalah tindakan berulang, dengan efek blok acak. Model ditentukan sebagai: mymod <- lmer(variable ~ treatment...
Saya menganalisis data pelacakan mata dari percobaan yang dirancang. Versi sederhana dari data saya terlihat seperti ini (Anda bisa mendapatkan data dput () di sini ), head(lookDATA) participant fixationImage fixationCount 1 9 Automobile 81 2 9 Bird 63 3 9 Chair 82 4 9 Dog 64 5 9 Face 90 6 9...
Dalam lmerfungsi di lme4dalam Rada panggilan untuk membangun model matriks efek acak, , seperti yang dijelaskan di sini , halaman 7 - 9.ZZZ Menghitung mensyaratkan KhatriRao dan / atau produk Kronecker dari dua matriks, dan X_i . J i X iZZZJiJiJ_iXiXiX_i Matriks JiJiJ_i adalah suap: "Matriks...
Sebagai bagian dari posting ini , saya bekerja pada simulasi data dengan variabel kontinu, meminjamkan diri untuk intersep dan lereng berkorelasi. Meskipun ada posting bagus tentang topik ini di situs , dan di luar situs , saya mengalami kesulitan dalam menemukan contoh awal-ke-akhir dengan data...
Jadi, saya memiliki 16 percobaan di mana saya mencoba untuk mengotentikasi seseorang dari sifat biometrik menggunakan Hamming Distance. Ambang batas saya diatur ke 3.5. Data saya di bawah dan hanya percobaan 1 yang Benar-Benar Positif: Trial Hamming Distance 1 0.34 2 0.37 3 0.34 4 0.29 5 0.55 6...
Saya memasang glmermodel dalam lme4paket R. Saya mencari tabel anova dengan nilai p yang ditunjukkan di sini, tetapi saya tidak dapat menemukan paket yang cocok. Apakah mungkin melakukannya di R? Model yang saya pas adalah dalam bentuk: model1<-glmer(dmn~period*teethTreated+(1|fullName),...
Saya memiliki beberapa kesulitan untuk mendapatkan hasil yang setara antara aovmodel tindakan berulang antara-dalam dan lmermodel campuran. Data dan skrip saya terlihat sebagai berikut data=read.csv("https://www.dropbox.com/s/zgle45tpyv5t781/fitness.csv?dl=1") data$id=factor(data$id) data id...
Dalam Model Generalized Linear Mixed logistik (family = binomial), saya tidak tahu bagaimana menafsirkan varians efek acak: Random effects: Groups Name Variance Std.Dev. HOSPITAL (Intercept) 0.4295 0.6554 Number of obs: 2275, groups: HOSPITAL, 14 Bagaimana cara menginterpretasikan hasil...
Saya mensimulasikan uji coba Bernoulli dengan acak logitθ∼N(logitθ0,12)logitθ∼N(logitθ0,12)\text{logit}\, \theta \sim {\cal N}(\text{logit}\, \theta_0, 1^2)antara kelompok dan kemudian saya cocokkan dengan model yang sesuai dengan lme4paket: library(lme4) library(data.table) I <- 30 # number of...