lme4 dan nlme adalah paket R yang digunakan untuk pemasangan model efek campuran linier, linier umum, dan nonlinier. Untuk pertanyaan umum tentang model campuran, gunakan tag [model campuran].
Ada banyak diskusi yang terjadi di forum ini tentang cara yang tepat untuk menentukan berbagai model hirarkis yang digunakan lmer. Saya pikir akan bagus jika memiliki semua informasi di satu tempat. Beberapa pertanyaan untuk memulai: Bagaimana cara menentukan beberapa level, di mana satu...
Inilah cara saya memahami efek acak bersarang vs. bersilangan: Efek acak bersarang terjadi ketika faktor level yang lebih rendah hanya muncul dalam level tertentu dari faktor level atas. Misalnya, siswa dalam kelas pada titik waktu tertentu. Dalam lme4saya pikir kami mewakili efek acak untuk...
Jika kita memasang glmer, kita mungkin mendapat peringatan yang memberitahu kita bahwa model tersebut mengalami kesulitan untuk berkumpul ... misalnya >Warning message: In checkConv(attr(opt, "derivs"), opt$par, ctrl = control$checkConv, : Model failed to converge with max|grad| = 0.00389462...
Menyesuaikan regresi logistik menggunakan lme4 berakhir dengan Error in mer_finalize(ans) : Downdated X'X is not positive definite. Kemungkinan penyebab kesalahan ini adalah kelangkaan peringkat. Apa itu kekurangan peringkat, dan bagaimana saya harus
Saya muat beberapa model efek campuran (terutama model longitudinal) menggunakan lme4di Rtetapi ingin benar-benar menguasai model dan kode yang terjadi dengan mereka. Namun, sebelum menyelam dengan kedua kaki (dan membeli beberapa buku) saya ingin memastikan bahwa saya belajar perpustakaan yang...
Saya menggunakan lme4 dalam R agar sesuai dengan model campuran lmer(value~status+(1|experiment))) di mana nilai kontinu, status dan percobaan adalah faktor, dan saya dapatkan Linear mixed model fit by REML Formula: value ~ status + (1 | experiment) AIC BIC logLik deviance REMLdev 29.1 46.98...
Baru-baru ini saya mengukur bagaimana arti kata baru diperoleh dari eksposur berulang (praktek: hari 1 hingga hari 10) dengan mengukur ERP (EEG) ketika kata itu dilihat dalam konteks yang berbeda. Saya juga mengendalikan sifat-sifat konteks, misalnya, kegunaannya untuk penemuan makna kata baru...
Saya bertanya-tanya apakah itu membuat perbedaan dalam interpretasi apakah hanya dependen, baik dependen dan independen, atau hanya variabel independen yang ditransformasikan log. Pertimbangkan kasus log(DV) = Intercept + B1*IV + Error Saya bisa menafsirkan IV sebagai peningkatan persen tetapi...
EDIT 2: Awalnya saya pikir saya perlu menjalankan ANOVA dua faktor dengan tindakan berulang pada satu faktor, tapi saya sekarang berpikir model efek campuran linear akan bekerja lebih baik untuk data saya. Saya pikir saya hampir tahu apa yang perlu terjadi, tetapi saya masih bingung dengan beberapa...
Secara numerik menurunkan MLE pada GLMM adalah sulit dan, dalam praktiknya, saya tahu, kita tidak boleh menggunakan optimasi brute force (misalnya, menggunakan optimdengan cara sederhana). Tetapi untuk tujuan pendidikan saya sendiri, saya ingin mencobanya untuk memastikan saya memahami model dengan...
Saya ingin mendapatkan interval prediksi sekitar prediksi dari model lmer (). Saya telah menemukan beberapa diskusi tentang ini: http://rstudio-pubs-static.s3.amazonaws.com/24365_2803ab8299934e888a60e7b16113f619.html http://glmm.wikidot.com/faq tetapi mereka tampaknya tidak memperhitungkan...
Effectspaket menyediakan cara yang sangat cepat dan mudah untuk memplot hasil model efek campuran linier yang diperoleh melalui lme4paket . The effectinterval fungsi menghitung kepercayaan (CI) sangat cepat, tapi bagaimana dapat dipercaya adalah interval keyakinan ini? Sebagai
Baru-baru ini saya menyadari bahwa model campuran dengan subjek hanya sebagai faktor acak dan faktor-faktor lain sebagai faktor tetap setara dengan ANOVA ketika menetapkan struktur korelasional dari model campuran ke senyawa simetri. Oleh karena itu saya ingin tahu apa arti dari simetri majemuk...
Saya memiliki data yang dikumpulkan dari percobaan yang diselenggarakan sebagai berikut: Dua situs, masing-masing dengan 30 pohon. 15 dirawat, 15 kontrol di setiap situs. Dari setiap pohon, kami mengambil sampel tiga potong batang, dan tiga potong akar, sehingga 6 tingkat 1 sampel per pohon yang...
Saya mencoba memahami kapan harus menggunakan efek acak dan kapan itu tidak perlu. Ive diberitahu aturan praktis adalah jika Anda memiliki 4 grup atau lebih yang saya lakukan (15 moose individu). Beberapa dari mereka rusa percobaan pada 2 atau 3 kali untuk total 29 percobaan. Saya ingin tahu apakah...
Saya ingin mencocokkan GLMM bertingkat dengan distribusi Poisson (dengan dispersi berlebih) menggunakan R. Saat ini saya menggunakan lme4 tetapi saya perhatikan bahwa baru-baru ini quasipoissonkeluarga telah dihapus. Saya telah melihat di tempat lain bahwa Anda dapat memodelkan over-dispersi...
Saya bertanya-tanya apakah ada yang bisa memberi tahu saya tentang perbedaan saat ini antara kedua fungsi ini. Saya menemukan pertanyaan berikut: Bagaimana memilih perpustakaan nlme atau lme4 R untuk model efek campuran? , tapi itu berasal dari beberapa tahun yang lalu. Itu seumur hidup di...
Mudah-mudahan ini adalah pertanyaan yang seseorang di sini dapat menjawab untuk saya tentang sifat dekomposisi jumlah kuadrat dari model efek campuran cocok dengan lmer(dari paket lme4 R). Pertama saya harus mengatakan bahwa saya menyadari kontroversi dengan menggunakan pendekatan ini, dan dalam...
Saya ingin mendapatkan nilai-p dan ukuran efek dari variabel kategori independen (dengan beberapa level) - yaitu "keseluruhan" dan tidak untuk setiap level secara terpisah, seperti output normal dari lme4dalam R. Ini seperti hal yang dilaporkan orang saat menjalankan ANOVA. Bagaimana saya bisa...
Dalam model multi-level, apa implikasi praktis dan terkait interpretasi parameter estimasi efek korelasi acak dan tidak diperkirakan? Alasan praktis untuk menanyakan hal ini adalah bahwa dalam kerangka lmer dalam R, tidak ada metode yang diimplementasikan untuk memperkirakan nilai-p melalui teknik...