Saya memiliki model berikut:
> model1<-lmer(aph.remain~sMFS1+sAG1+sSHDI1+sbare+season+crop
+(1|landscape),family=poisson)
... dan ini adalah output ringkasan.
> summary(model1)
Generalized linear mixed model fit by the Laplace approximation
Formula: aph.remain ~ sMFS1 + sAG1 + sSHDI1 + sbare + season + crop
+ (1 | landscape)
AIC BIC logLik deviance
4057 4088 -2019 4039
Random effects:
Groups Name Variance Std.Dev.
landscape (Intercept) 0.74976 0.86588
Number of obs: 239, groups: landscape, 45
Fixed effects:
Estimate Std. Error z value Pr(>|z|)
(Intercept) 2.6613761 0.1344630 19.793 < 2e-16
sMFS1 0.3085978 0.1788322 1.726 0.08441
sAG1 0.0003141 0.1677138 0.002 0.99851
sSHDI1 0.4641420 0.1619018 2.867 0.00415
sbare 0.4133425 0.0297325 13.902 < 2e-16
seasonlate -0.5017022 0.0272817 -18.390 < 2e-16
cropforage 0.7897194 0.0672069 11.751 < 2e-16
cropsoy 0.7661506 0.0491494 15.588 < 2e-16
Correlation of Fixed Effects:
(Intr) sMFS1 sAG1 sSHDI1 sbare sesnlt crpfrg
sMFS1 -0.007
sAG1 0.002 -0.631
sSHDI1 0.000 0.593 -0.405
sbare -0.118 -0.003 0.007 -0.013
seasonlate -0.036 0.006 -0.006 0.003 -0.283
cropforage -0.168 -0.004 0.016 -0.014 0.791 -0.231
cropsoy -0.182 -0.028 0.030 -0.001 0.404 -0.164 0.557
Ini mungkin overdispersed, tetapi bagaimana tepatnya saya menghitung ini?
Terima kasih banyak.
qcc.overdispersion.test
sesuai (ini menguji overdispersi dalam data binomial mentah , bukan dalam model)Jawaban:
Di antara banyak tidbits berguna lainnya pada GLMM dengan lmer () dan perangkat lunak pemasangan GLMM lainnya, periksa bagian pada halaman web berikut yang disebut Bagaimana saya bisa menangani penyebaran berlebih dalam GLMM?
http://glmm.wikidot.com/faq
sumber
Paket AER (hal.33) memiliki uji Cameron & Trivedi dari asumsi equidispersion yang dapat digunakan dengan GLM.
sumber