In gene expression studies using microarrays, intensity data has to be normalized so that intensities can be compared between individuals, between genes. Conceptually, and algorithmically, how does "quantile normalization" work, and how would you explain this to a
Jika FZFZF_Z adalah CDF, sepertinya FZ(z)αFZ(z)αF_Z(z)^\alpha ( α>0α>0\alpha \gt 0 ) adalah CDF juga. T: Apakah ini hasil standar? T: Apakah ada cara yang baik untuk menemukan fungsi ggg dengan X≡g(Z)X≡g(Z)X \equiv g(Z) st FX(x)=FZ(z)αFX(x)=FZ(z)αF_X(x) = F_Z(z)^\alpha , di mana...
Apa pro dan kontra dari belajar tentang sifat distribusi secara algoritmik (melalui simulasi komputer) versus matematis? Sepertinya simulasi komputer dapat menjadi metode pembelajaran alternatif, terutama bagi siswa baru yang tidak merasa kuat dalam kalkulus. Juga tampaknya bahwa simulasi...
Saya telah menerima hasil dari tes peringkat Mann-Whitney yang saya tidak mengerti. Median 2 populasi identik (6,9). Kuantitas atas dan yang lebih rendah dari setiap populasi adalah: 6.64 & 7.2 6.60 & 7.1 Nilai p yang dihasilkan dari uji yang membandingkan populasi ini adalah 0,007....
Apakah ada alasan apa yang dapat saya pikirkan, untuk mengubah data dengan akar kuadrat? Maksud saya yang selalu saya amati adalah bahwa R ^ 2 meningkat. Tapi ini mungkin hanya karena memusatkan data! Pikiran apa pun
Sebagai seorang mahasiswa dalam bidang fisika, saya telah mengalami kuliah "Mengapa saya seorang Bayesian" mungkin setengah lusin kali. Itu selalu sama - presenter dengan sombong menjelaskan bagaimana penafsiran Bayesian lebih unggul daripada interpretasi yang sering digunakan oleh massa. Mereka...
Saya akan tertarik untuk menemukan cara dalam R untuk memperbarui model linier secara efisien ketika pengamatan atau prediktor ditambahkan. biglm memiliki kemampuan memperbarui ketika menambahkan pengamatan, tetapi data saya cukup kecil untuk berada di memori (walaupun saya memiliki sejumlah besar...
Saya membaca bahwa dalam aturan Bayes, penyebut dariPr ( data )Pr(data)\Pr(\textrm{data}) Pr ( parameter ∣ data ) = Pr ( data ∣ parameter ) Pr ( parameter )Pr ( data )Pr(parameter∣data)=Pr(data∣parameter)Pr(parameter)Pr(data)\Pr(\text{parameters} \mid \text{data}) = \frac{\Pr(\textrm{data} \mid...
Saya memiliki pemahaman yang kabur tentang apa metode penyampaian pesan: sebuah algoritma yang membangun perkiraan untuk suatu distribusi dengan secara iteratif membangun perkiraan masing-masing faktor distribusi yang tergantung pada semua perkiraan semua faktor lainnya. Saya percaya bahwa...
Apa aturan praktis yang baik untuk bagaimana memilih pertanyaan untuk hipotesis nol. Misalnya, jika saya ingin memeriksa apakah hipotesis B benar, haruskah saya menggunakan B sebagai nol, B sebagai hipotesis alternatif, atau B bukan sebagai nol? Saya harap pertanyaannya jelas. Saya tahu bahwa ini...
Katakanlah saya memiliki percobaan faktorial 2x2 sederhana yang ingin saya lakukan ANOVA. Seperti ini, misalnya: d <- data.frame(a=factor(sample(c('a1','a2'), 100, rep=T)), b=factor(sample(c('b1','b2'), 100, rep=T))); d$y <- as.numeric(d$a)*rnorm(100, mean=.75, sd=1) +
Ketika melakukan GLM dan Anda mendapatkan kesalahan "tidak ditentukan karena singularitas" di output anova, bagaimana cara menangkal kesalahan ini terjadi? Beberapa orang berpendapat bahwa ini disebabkan oleh kolinearitas antara kovariat atau salah satu level tidak ada dalam dataset (lihat:...
Baru-baru ini saya telah melakukan beberapa analisis tentang efek reputasi pada upvote (lihat posting blog ), dan kemudian saya punya beberapa pertanyaan tentang analisis dan grafik yang mungkin lebih mencerahkan (atau lebih tepat). Jadi beberapa pertanyaan (dan jangan ragu untuk menanggapi siapa...
Saya mencoba menggunakan fungsi ' density ' di R untuk melakukan estimasi kepadatan kernel. Saya mengalami beberapa kesulitan menafsirkan hasil dan membandingkan berbagai dataset karena tampaknya area di bawah kurva belum tentu 1. Untuk setiap fungsi kepadatan probabilitas (pdf) , kita perlu...
Katakanlah saya memiliki variabel kategori yang dapat mengambil nilai A, B, C, dan D. Bagaimana saya bisa menghasilkan 10.000 poin data acak dan mengontrol frekuensi masing-masing? Sebagai contoh: A = 10% B = 20% C = 65% D = 5% Ada ide bagaimana saya bisa melakukan
Bagaimana saya bisa menghasilkan deret waktu biner sehingga: Probabilitas rata-rata mengamati 1 ditentukan (misalnya 5%); Probabilitas kondisional untuk mengamati 1 pada waktu diberi nilai pada t - 1 (katakanlah 30% jika nilai t - 1 adalah
Pertimbangkan deret waktu sederhana: > tp <- seq_len(10) > tp [1] 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 kita dapat menghitung matriks adjacency untuk deret waktu ini yang mewakili hubungan temporal antar sampel. Dalam menghitung matriks ini, kami menambahkan situs imajiner pada waktu 0 dan tautan...
Terkunci . Pertanyaan ini dan jawabannya dikunci karena pertanyaannya di luar topik tetapi memiliki makna historis. Saat ini tidak menerima jawaban atau interaksi baru. Saya memiliki grafik seperti ini: Kode R untuk menghasilkannya adalah: DF <- data.frame(date =...
Misalkan saya memiliki sampel dari dua populasi yang berbeda. Jika saya mengukur berapa lama setiap anggota untuk melakukan tugas, saya dapat dengan mudah memperkirakan rata-rata dan varians dari setiap populasi. Jika sekarang saya berhipotesiskan pasangan acak dengan satu individu dari setiap...
The halaman bantuan untuk Prism memberikan penjelasan berikut untuk bagaimana menghitung band prediksi untuk regresi non-linear. Maafkan kutipan panjang, tapi saya tidak mengikuti paragraf kedua (yang menjelaskan bagaimana didefinisikan dan dihitung). Bantuan apa pun akan sangat dihargai.d Y / d...