Studi pemecahan masalah komputasi dengan memanfaatkan penggunaan beberapa prosesor secara bersamaan.
Saya sedang mempertimbangkan mempelajari bahasa baru untuk digunakan untuk proyek pemodelan numerik / simulasi, sebagai pengganti (sebagian) untuk C ++ dan Python yang saat ini saya gunakan. Saya menemukan Julia , yang terdengar sempurna. Jika ia melakukan semua yang diklaimnya, saya dapat...
Saat ini saya sedang mencari metode paralel untuk integrasi ODE. Ada banyak literatur baru dan lama di luar sana yang menggambarkan berbagai pendekatan, tetapi saya belum menemukan survei terbaru atau artikel ikhtisar yang menggambarkan topik secara umum. Ada buku karya Burrage [1], tetapi sudah...
Saya mencari informasi dari siapa saja yang telah mencoba menggunakan OpenCL dalam kode ilmiah mereka. Adakah yang pernah mencoba (baru-baru ini) ViennaCL ? Jika demikian, bagaimana jika dibandingkan dengan puncak ? Bagaimana dengan OCLTools ? Apakah itu memenuhi janji? Jika demikian, apakah ini...
Apakah ada alat dalam Python yang seperti parl Matlab? Saya menemukan utas ini , tetapi sudah berusia empat tahun. Saya pikir mungkin seseorang di sini mungkin memiliki pengalaman yang lebih baru. Berikut adalah contoh jenis hal yang ingin saya pisahkan: X = np.random.normal(size=(10, 3)) F =...
Pertanyaan ini dimigrasikan dari Stack Overflow karena dapat dijawab di Computational Science Stack Exchange. Bermigrasi 7 tahun yang lalu . Adakah masalah / algoritme terkenal dalam komputasi ilmiah yang tidak dapat dipercepat dengan paralisis? Sepertinya saya ketika
Bagaimana masalah gravitasi n-tubuh diselesaikan secara numerik secara paralel? Apakah tradeoff presisi-kompleksitas mungkin? Bagaimana presisi mempengaruhi kualitas model?
Saya tidak menjalankan kode paralel apa pun sekarang, tapi saya mengantisipasi menjalankan kode paralel di masa depan menggunakan hibrida OpenMP dan MPI. Debugger adalah alat yang sangat berharga bagi saya ketika menjalankan proyek seri. Adakah yang bisa merekomendasikan debugger paralel (atau...
Saya memiliki aplikasi yang dapat diparalelkan secara sepele tetapi kinerjanya sebagian besar terikat I / O. Aplikasi membaca larik input tunggal yang disimpan dalam file yang biasanya berukuran 2-5 GB (tapi saya berharap angka ini bertambah di masa mendatang). Perhitungan tipikal berlaku operasi...
Ingin memperbaiki pos ini? Berikan jawaban terinci untuk pertanyaan ini, termasuk kutipan dan penjelasan mengapa jawaban Anda benar. Jawaban tanpa detail yang cukup dapat diedit atau dihapus. Adaptive mesh refinement (AMR) adalah teknik umum untuk menangani masalah
Pengurangan paralel mengasumsikan bahwa operasi yang sesuai adalah asosiatif. Asumsi ini dilanggar karena penambahan angka floating point. Anda mungkin bertanya mengapa saya peduli tentang ini. Yah, itu membuat hasil yang kurang dapat direproduksi. Dan menjadi lebih buruk ketika anil simulasi...
Tesis saya adalah mengembangkan metode numerik untuk pengurangan model dalam pembakaran. Saya menjalankan metode saya murni pada bagian kimia dari simulasi pembakaran, dan saya punya banyak studi kasus untuk simulasi 0-D (tidak ada aliran). Yang saya inginkan adalah menjalankan simulasi yang...
Banyak pekerjaan saya sendiri berkisar membuat skala algoritma lebih baik, dan salah satu cara yang disukai untuk menunjukkan penskalaan paralel dan / atau efisiensi paralel adalah untuk memplot kinerja algoritma / kode pada jumlah inti, misalnya di mana sumbu mewakili jumlah core dan sumbu...
Maaf untuk posting lama tapi saya ingin memasukkan semua yang saya pikir relevan pada langkah pertama. Apa yang saya inginkan Saya menerapkan versi paralel dari Metode Subruang Krylov untuk Matriks Padat.Terutama GMRES, QMR dan CG. Saya menyadari (setelah membuat profil) bahwa rutinitas DGEMV...
Saya menjalankan simulasi dinamika molekul (MD) menggunakan beberapa paket perangkat lunak, seperti Gromacs dan DL_POLY. Gromacs sekarang mendukung algoritma dekomposisi partikel dan domain dekomposisi. Secara default, simulasi Gromacs menggunakan dekomposisi domain, meskipun selama...
Saya mengoptimalkan fungsi 10-20 variabel. Berita buruknya adalah bahwa setiap evaluasi fungsi mahal, kira-kira 30 menit dari perhitungan serial. Kabar baiknya adalah bahwa saya memiliki cluster dengan beberapa lusin node komputasi yang saya miliki. Jadi pertanyaannya: apakah ada algoritma...
Dalam solusi numerik PDE nilai batas awal, sangat umum untuk menggunakan paralelisme dalam ruang . Adalah jauh lebih jarang untuk menggunakan beberapa bentuk paralelisme dalam diskritisasi waktu , dan bahwa paralelisme biasanya jauh lebih terbatas. Saya menyadari semakin banyak kode dan karya yang...
Saya memparalelkan kode untuk memecahkan model keseimbangan populasi 5 dimensi secara numerik. Saat ini saya memiliki kode paralel MPICH2 yang sangat baik di FORTRAN tetapi ketika kami meningkatkan nilai parameter array menjadi terlalu besar untuk dijalankan dalam mode memori terdistribusi. Saya...
Biasanya, saya menulis kode seri, dan ketika saya melakukannya, saya menulis unit test dengan beberapa kerangka pengujian gaya xUnit (MATLAB xUnit, PyUnit / nose, atau kerangka pengujian C ++ Google). Berdasarkan pencarian Google sepintas, saya belum melihat banyak tentang bagaimana praktisi...
Saya memiliki koleksi model komputasi yang dapat digambarkan sebagai automata seluler asinkron. Model-model ini menyerupai model Ising, tetapi sedikit lebih rumit. Sepertinya model seperti itu akan mendapat manfaat dari dijalankan pada GPU daripada CPU. Sayangnya itu tidak cukup mudah untuk...
Seperti yang saya pahami, metode multigrid memecahkan sistem linier dengan menyelesaikan versi yang lebih kasar dari masalah yang sama (di sana dengan menghilangkan kesalahan frekuensi rendah) kemudian memproyeksikan kembali ke jaringan halus untuk meluruskan kesalahan frekuensi tinggi. Untuk...