Di salah satu makalah saya, saya mencantumkan beberapa hasil numerik di samping beberapa angka. Yang ingin saya lakukan adalah memastikan bahwa hasil numerik dalam makalah saya selalu setuju dengan kode. Saat ini, saya hanya langsung menyalin hasil numerik dari hasil simulasi saya ke dalam kertas,...
Reproduksibilitas menjadi semakin penting dalam penelitian sains komputasi. (Sebagai contoh, lihat artikel ini oleh Roger Peng di Science ; Saya juga mengetahui artikel dan situs web seperti itu.) Namun, tidak jelas bagi saya berapa banyak informasi yang harus saya sertakan dengan artikel jurnal...
Penelitian yang dapat direproduksi dalam perhitungan bertujuan untuk membuat kode yang diperlukan untuk menghasilkan hasil dalam makalah komputasi yang tersedia bagi peneliti lain sehingga mereka dapat menjalankan kode ini untuk mereproduksi hasil dalam makalah itu. Saya ingin membuat semua...
Pengurangan paralel mengasumsikan bahwa operasi yang sesuai adalah asosiatif. Asumsi ini dilanggar karena penambahan angka floating point. Anda mungkin bertanya mengapa saya peduli tentang ini. Yah, itu membuat hasil yang kurang dapat direproduksi. Dan menjadi lebih buruk ketika anil simulasi...
Saya menulis sebuah program / perpustakaan yang saya gunakan untuk mendapatkan hasil dalam sebuah artikel. (Di sini adalah , tapi pertanyaan saya adalah umum.) Saya harus tes yang saya jalankan secara teratur menggunakan ctest(dibutuhkan beberapa menit untuk berjalan). Untuk mereproduksi beberapa...
Saya sedang menulis makalah yang dapat direproduksi, dan makalah ini memiliki hasil komputasi yang dihasilkan oleh skrip Python (skrip MATLAB serupa menghasilkan hasil yang hampir identik). Saya merasa bahwa makalah ini akan lebih mudah dipahami oleh pembaca jika mereka dapat mencocokkan...
Biasanya, saya menulis kode seri, dan ketika saya melakukannya, saya menulis unit test dengan beberapa kerangka pengujian gaya xUnit (MATLAB xUnit, PyUnit / nose, atau kerangka pengujian C ++ Google). Berdasarkan pencarian Google sepintas, saya belum melihat banyak tentang bagaimana praktisi...
Physics, biology, chemistry etc. have different sets of rules for making experiments: what events are considered relevant, how to avoid contamination of samples, how to create and fix a reproducing process and so on. What are standards, protocols and best practices in ensure accuracy and...
Apakah ada daftar praktik terbaik yang dipublikasikan untuk memastikan umur kode yang panjang, dengan pandangan terhadap hasil ilmiah yang dapat direproduksi? (mis. open source, praktik dokumentasi, memilih dependensi, memilih bahasa, mesin virtual, dll). Tahu ada studi (atau kurang itu, contoh /...