Saya sedang mengembangkan beberapa kode yang lebih besar untuk melakukan perhitungan nilai eigen dari matriks jarang besar, dalam konteks fisika komputasi. Saya menguji rutinitas saya terhadap osilator harmonik sederhana dalam satu dimensi, karena nilai eigen dikenal secara analitis. Melakukannya...
Grup penelitian saya berfokus pada dinamika molekuler, yang jelas dapat menghasilkan gigabytes data sebagai bagian dari lintasan tunggal yang kemudian harus dianalisis. Beberapa masalah yang kami khawatirkan melibatkan korelasi dalam set data, yang berarti bahwa kita perlu melacak sejumlah besar...
Saya sedang menulis makalah yang dapat direproduksi, dan makalah ini memiliki hasil komputasi yang dihasilkan oleh skrip Python (skrip MATLAB serupa menghasilkan hasil yang hampir identik). Saya merasa bahwa makalah ini akan lebih mudah dipahami oleh pembaca jika mereka dapat mencocokkan...
Saya ingin menerapkan ekspresi berikut dalam Python: mana x dan y adalah array numpy dengan ukuran n , dan k adalah array numpy ukuran n × n . Ukuran n mungkin hingga sekitar 10.000, dan fungsinya adalah bagian dari loop dalam yang akan dievaluasi berkali-kali, jadi kecepatan itu penting.xsaya=...
Adakah orang di sini yang menggunakan komputasi ilmiah presisi ganda dengan GPU generasi baru (misalnya K20) melalui Python? Saya tahu bahwa teknologi ini berkembang pesat, tetapi apa cara terbaik untuk melakukan ini saat ini? GPU berada di luar ruang lingkup untuk perpustakaan ilmiah Python...
Saya telah menggunakan metode yang berbeda untuk menghitung peringkat matriks dan solusi sistem persamaan matriks. Saya menemukan fungsi linalg.svd. Membandingkan ini dengan upaya saya sendiri untuk memecahkan sistem dengan Gaussian Elimination, tampaknya lebih cepat dan lebih tepat. Saya mencoba...
Saya mengalami beberapa frustrasi atas cara matlab menangani integrasi numerik vs Scipy. Saya mengamati perbedaan berikut dalam kode pengujian saya di bawah ini: Versi Matlab berjalan rata-rata 24 kali lebih cepat dari yang setara dengan python saya! Versi Matlab mampu menghitung integral tanpa...
Saya mengalami masalah dalam mengimplementasikan fungsi secara numerik. Itu menderita dari kenyataan bahwa pada nilai input besar hasilnya adalah jumlah yang sangat besar kali jumlah yang sangat kecil. Saya tidak yakin apakah pembatalan katastropik adalah istilah yang tepat, jadi mohon perbaiki...
Saya harus menyelesaikannya s.t.minx∥Ax−b∥22,∑ixi=1,xi≥0,∀i.minx‖Ax−b‖22,s.t.∑ixi=1,xi≥0,∀i.\begin{alignat}{1} & \min_{x}\|Ax - b\|^2_{2}, \\ \mathrm{s.t.} & \quad\sum_{i}x_{i} = 1, \\ & \quad x_{i} \geq 0, \quad \forall{i}. \end{alignat} Saya pikir ini adalah masalah kuadrat yang harus...
Inti dari pertanyaan saya adalah sebagai berikut: Saya memiliki sistem dua ODE. Yang satu memiliki batasan nilai awal dan yang lainnya memiliki batasan nilai akhir. Ini dapat dianggap sebagai sistem tunggal dengan batasan nilai awal pada beberapa variabel dan batasan nilai akhir pada yang...
Saya mencoba mencari tahu apakah ada cara yang lebih cepat untuk menghitung semua nilai eigen dan vektor eigen dari matriks adjacency yang sangat besar dan jarang daripada menggunakan scipy.sparse.linalg.eigsh Sejauh yang saya tahu, metode ini hanya menggunakan sparseness dan atribut simetri dari...
Saya baru dalam pemrograman dan saya mencoba untuk menyelesaikan masalah besar pertama saya dan menulis program besar pertama saya. Saya telah mencari contoh kode sumber terbuka untuk dipelajari, tetapi sejauh ini hanya menemukan kode dalam bahasa yang tidak sepenuhnya saya pahami atau yang terkait...
Saya memiliki masalah fisik yang diatur oleh persamaan Poisson dalam dua dimensi Saya memiliki pengukuran dua komponen gradien ∂ u / ∂ x dan ∂ u / ∂ y sepanjang beberapa bagian batas, Γ m , jadi ingin memaksakan ∂ u−∇2u=f(x,y),inΩ−∇2u=f(x,y),inΩ -\nabla^2 u = f(x,y), \; in \;...
Saya memiliki dataset titik 3-dimensi yang ingin saya buat mesh, menggunakan python. Semua perangkat lunak yang saya lihat mengharuskan Anda memberikan tepi. Apakah ada program dalam python yang mengambil input satu set poin dalam 3D dan output jala? Jika memungkinkan, saya ingin sambungannya...
Harap cantumkan paket Python (petsc4py, dll ...) dan pemecah langsung yang jarang didukungnya. Tolong, satu (komunitas-wiki) jawaban per
Saya harus menulis kode volume terbatas untuk Magnetohydrodynamics (MHD). Saya telah menulis kode numerik sebelumnya tetapi tidak pada skala ini. Saya hanya ingin bertanya yang akan menjadi pilihan yang baik, menggunakan struktur data (pendekatan berorientasi objek) dengan kelas atau hanya...
CVXOPT: http://abel.ee.ucla.edu/cvxopt/index.html OpenOpt: http://openopt.org/Welcome Apa hubungan mereka? Apa kelebihan / kekurangan masing-masing? BTW, apakah ada perpustakaan optimasi cembung tujuan umum berkualitas tinggi lainnya untuk Python / C ++ yang patut
Seberapa lambatkah petsc4py vs c / c ++ / fortran? Saya menyadari itu akan sangat tergantung pada kode yang dieksekusi, tetapi bagaimana dengan sesuatu yang sederhana seperti produk
Apakah ada algoritma untuk deteksi komunitas untuk grafik bipartit (jaringan 2-mode) yang diterapkan dalam igraph, networkX, R atau Python dll? Secara khusus, adakah implementasi seperti itu di mana seseorang akan dapat membatasi deteksi komunitas hanya pada salah satu dari dua
Saya mencoba menerapkan metode Runge-Kutta urutan keempat untuk menyelesaikan urutan pertama ODE di Python yaitu . Saya mengerti bagaimana metode ini bekerja, tetapi saya mencoba untuk menulis algoritma yang efisien yang meminimalkan jumlah kali dihitung karena ini cukup mahal. Saya telah...