Saya telah mencoba membuat model spasial 2D yang akurat secara biologis dari lapisan jaringan, di mana proses fisiologis yang berbeda terjadi. Ini termasuk terutama reaksi kimia, difusi dan fluks terhadap batas.
Saya membuat model ini dalam COMSOL Multiphysics, paket perangkat lunak elemen hingga yang memecahkan fisika yang berbeda seperti sistem difusi reaksi, meskipun untuk pertanyaan saya ini mungkin tidak benar-benar relevan.
Dalam geometri saya, saya memiliki daerah yang sangat kecil di antara sel-sel lapisan jaringan. Daerah ini berfungsi sebagai bukaan di mana difusi dapat terjadi di antara sel (persimpangan). Kualitas mesh tidak bagus di sini dan jika saya ingin meningkatkan kualitas (terutama dengan memperkenalkan lebih banyak elemen dan semacamnya), waktu simulasi saya meningkat secara drastis. Jaring berkualitas lebih rendah juga menyebabkan konvergensi lebih lama. Saya menambahkan gambar geometri untuk memberikan ide. Saya mencoba jerat yang berbeda, semua dengan kualitas elemen yang berbeda dan jumlah elemen mulai dari 16000 hingga 50.000.
Latar belakang saya di FEM sangat terbatas dan saya ingin tahu apakah saya bisa mengatasi masalah ini sedemikian rupa sehingga:
- tidak berdampak negatif terhadap biologi (pertahankan ukuran / masalah domain jaringan, dll. seakurat mungkin),
- tidak meningkatkan waktu simulasi secara drastis,
- memberikan kualitas jala yang lebih baik. Jadi saya benar-benar ingin tahu apa cara terbaik untuk pergi, karena saya sudah memikirkan beberapa hal.
Jadi saya dapat menggunakan mesh kualitas yang lebih rendah (yang tidak terlalu buruk, tetapi juga tidak baik), sehingga saya dapat menjaga daerah kecil untuk akurasi biologis yang optimal dan memiliki waktu komputasi yang relatif kecil (dan berharap saya tidak akan bertemu dengan kesalahan konvergensi). Tapi mungkin ada beberapa kemungkinan yang saya lewatkan, misalnya: apakah mungkin untuk membuat domain kecil lebih besar dan kemudian menambahkan beberapa jenis faktor ke tingkat difusi. Dengan kata lain, jika saya ingin membuat domain dua kali lebih besar, apakah saya memfaktorkan tingkat difusi menjadi setengah? Apakah itu bahkan akurat dalam hukum kimia / fisika: S.
Mudah-mudahan saya membuat masalahnya sedikit jelas dan terima kasih banyak sebelumnya atas bantuannya.
Bersulang,