Proporsi varian yang dijelaskan dalam model efek-campuran

Saya tidak tahu apakah ini sudah ditanyakan sebelumnya, tetapi saya tidak menemukan apa-apa tentang itu. Pertanyaan saya adalah apakah ada yang bisa memberikan referensi yang baik untuk belajar bagaimana mendapatkan proporsi varian yang dijelaskan oleh masing-masing faktor tetap dan acak dalam model efek campuran.

Saya dapat memberikan beberapa referensi:

Xu, R. (2003). Mengukur variasi yang dijelaskan dalam model efek campuran linier. Statistik dalam Kedokteran , 22 , 3527-3541. DOI: 10.1002 / sim.1572

$R^2$

Hössjer, O. (2008). Pada koefisien determinasi untuk model regresi campuran. Jurnal Perencanaan Statistik dan Inferensi , 138 , 3022-3038. DOI: 10.1016 / j.jspi.2007.11.010

$R^2$

Selamat membaca!

MuMInR$^2$$^1$

#load packages
library(lme4)
library(MuMIn)

#Fit Model
m <- lmer(mpg ~ gear + disp + (1|cyl), data = mtcars)

#Determine R2:
r.squaredGLMM(m) 

       R2m       R2c 
 0.5476160 0.7150239  

Output untuk fungsi r.squaredGLMMmenyediakan:

• R2m : nilai kuadrat R marjinal yang terkait dengan efek tetap

• Nilai R2 bersyarat R2c terkait dengan efek tetap ditambah efek acak.

Catatan: komentar pada posting blog tertaut menunjukkan bahwa pendekatan alternatif yang diilhami Nakagawa & Schielzeth yang dikembangkan oleh Jon Lefcheck (menggunakan sem.model.fitsfungsi dalam piecewiseSEMpaket) menghasilkan hasil yang identik. [Jadi Anda punya opsi: p].

• Saya tidak menguji fungsi terakhir ini, tapi saya menguji r.squaredGLMM()fungsi dalam MuMInpaket dan dapat membuktikan bahwa itu masih berfungsi hari ini (2018).

• $^2$

^{1: Nakagawa, S., dan Schielzeth, H. 2013. Metode umum dan sederhana untuk mendapatkan R2 dari model efek campuran linier umum. Metode dalam Ekologi dan Evolusi 4 (2): 133-142.}

^{2: Johnson, PCD 2014, ekstensi R2GLMM Nakagawa & Schielzeth ke model lereng acak. Metode dalam Ekologi dan Evolusi 5: 44-946.}