Tes post-hoc setelah Kruskal-Wallis: tes Dunn atau Bonferroni mengoreksi tes Mann-Whitney?

Saya memiliki beberapa variabel terdistribusi non-Gaussian dan saya perlu memeriksa apakah ada perbedaan yang signifikan antara nilai-nilai variabel ini dalam 5 kelompok yang berbeda.

Saya telah melakukan analisis varian satu arah Kruskal-Wallis (yang muncul signifikan) dan setelah itu saya harus memeriksa kelompok mana yang berbeda secara signifikan. Karena kelompok-kelompok semacam diurutkan (nilai-nilai variabel dalam kelompok pertama seharusnya lebih rendah dari nilai-nilai variabel dalam kelompok kedua yang seharusnya lebih rendah dari nilai-nilai variabel dalam kelompok ketiga dan sebagainya). aktif) Saya hanya melakukan 4 tes:

Group 1 vs Group 2
Group 2 vs Group 3
Group 3 vs Group 4
Group 4 vs Group 5

Saya telah melakukan analisis ini dengan dua metode berbeda. Saya mulai dengan menggunakan Uji Perbandingan Berganda Dunn tetapi tidak ada yang signifikan. Di sisi lain jika saya menggunakan tes Mann-Whitney dan mengoreksi jumlah tes (4) menggunakan Bonferroni, 3 tes muncul signifikan.

Apa artinya? Hasil mana yang harus saya percayai?

hypothesis-testing post-hoc wilcoxon-mann-whitney kruskal-wallis dunn-test Rossella
sumber

Perhatikan bahwa jika Anda apriori mengharapkan nilai Grup 1 menjadi yang terendah dan Grup 5 tertinggi, maka membandingkan Grup 1 dengan Grup 5 akan memiliki kekuatan tertinggi untuk mendeteksi perbedaan.

Amuba kata Reinstate Monica

Pada koreksi Bonferroni, Anda harus membagi nilai p dengan jumlah kelompok, bukan jumlah tes yang Anda lakukan.

Caramba

Jika alternatif Anda dipesan, akan lebih baik menggunakan tes yang dirancang untuk situasi itu.

Glen_b -Reinstate Monica

Jawaban:

Anda harus menggunakan tes Dunn . Jika seseorang melanjutkan dengan bergerak dari penolakan Kruskal-Wallis ke melakukan tes jumlah rangking pasangan biasa (dengan atau tanpa beberapa penyesuaian perbandingan), orang mengalami dua masalah: (1) peringkat yang digunakan oleh tes jumlah peringkat pasangan-bijaksana menggunakan bukan peringkat yang digunakan oleh tes Kruskal-Wallis; dan (2) uji Dunn mempertahankan varian yang dikumpulkan untuk tes yang tersirat oleh hipotesis nol Kruskal-Wallis. $^{*}$

Tentu saja, seperti halnya tes omnibus (mis. ANOVA, Cochran's Q , dll.), Tes post hoc setelah penolakan tes Kruskal-Wallis yang telah disesuaikan untuk beberapa perbandingan mungkin gagal untuk menolak semua tes berpasangan untuk keluarga tertentu. tingkat kesalahan atau diberikan tingkat penemuan palsu yang sesuai dengan diberikan untuk tes omnibus. $\alpha$

$^{*}$ Uji Dunn diimplementasikan dalam Stata dalam paket dunntest (dalam tipe Stata net describe dunntest, from(https://alexisdinno.com/stata)), dan dalam R dalam paket dunn.test . Peringatan: ada beberapa tes post-hoc pair-wise yang kurang terkenal untuk mengikuti Kruskal-Wallis yang ditolak, termasuk Conover-Iman (seperti Dunn, tetapi berdasarkan distribusi t , daripada distribusi z ) yang diterapkan untuk Stata dalam paket conovertest (dalam tipe Stata net describe conovertest, from(https://alexisdinno.com/stata)), dan untuk R dalam paket conover.test , dan tes Dwass-Steel-Critchlow-Fligner.

Alexis
sumber