Saya memiliki simulasi di mana seekor hewan ditempatkan di lingkungan yang bermusuhan dan diatur waktunya untuk melihat berapa lama ia dapat bertahan hidup menggunakan beberapa pendekatan untuk bertahan hidup. Ada tiga pendekatan yang bisa digunakan untuk bertahan hidup. Saya menjalankan 300 simulasi hewan menggunakan setiap pendekatan bertahan hidup. Semua simulasi terjadi di lingkungan yang sama tetapi ada beberapa keacakan sehingga berbeda setiap kali. Saya menghitung berapa detik binatang itu bertahan dalam setiap simulasi. Hidup lebih lama lebih baik. Data saya terlihat seperti ini:
Approach 1, Approach 2, Approach 2
45,79,38
48,32,24
85,108,44
... 300 rows of these
Saya tidak yakin dengan semua yang saya lakukan setelah titik ini, jadi beri tahu saya jika saya melakukan sesuatu yang bodoh dan salah. Saya mencoba mencari tahu apakah ada perbedaan statistik pada umur menggunakan pendekatan tertentu.
Saya menjalankan tes Shapiro pada masing-masing sampel dan mereka kembali dengan nilai p kecil, jadi saya percaya data tidak dinormalisasi.
Data pada baris tidak memiliki hubungan satu sama lain. Benih acak yang digunakan untuk setiap simulasi berbeda. Akibatnya, saya percaya data tidak dipasangkan.
Karena data tidak dinormalisasi, tidak dipasangkan dan ada lebih dari dua sampel, saya menjalankan tes Kruskal Wallis yang kembali dengan nilai p 0,048. Saya kemudian pindah ke post hoc, memilih Mann Whitney. Benar-benar tidak yakin apakah Mann Whitney harus digunakan di sini.
Saya membandingkan masing-masing pendekatan survival dengan satu sama lain pendekatan dengan melakukan tes Mann Whitney yaitu {(pendekatan 1, pendekatan 2), (pendekatan 1, pendekatan 3), (pendekatan 2, pendekatan 3)}. Tidak ada temuan signifikansi statistik antara pasangan (pendekatan 2, pendekatan 3) menggunakan uji dua sisi tetapi ada perbedaan signifikansi yang ditemukan menggunakan uji satu sisi.
Masalah:
- Saya tidak tahu apakah menggunakan Mann Whitney seperti ini masuk akal.
- Saya tidak tahu apakah saya harus menggunakan Mann Whitney satu atau dua ekor.
Jawaban:
Berikut ini alasannya: Tes Dunn adalah tepat post hoc tes * menyusul penolakan dari uji Kruskal-Wallis. Jika seseorang melanjutkan dengan bergerak dari penolakan Kruskal-Wallis ke melakukan tes peringkat pasangan-bijaksana biasa (yaitu Wilcoxon atau Mann-Whitney) tes, maka dua masalah memperoleh: (1) peringkat yang digunakan untuk tes jumlah peringkat pasangan-bijaksana adalah bukan peringkat yang digunakan oleh tes Kruskal-Wallis; dan (2) tes peringkat jumlah tidak menggunakan varian gabungan yang disiratkan oleh hipotesis nol Kruskal-Wallis. Tes Dunn tidak memiliki masalah ini
Kecuali jika Anda memiliki alasan untuk meyakini bahwa waktu bertahan hidup satu kelompok lebih panjang atau lebih pendek daripada apriori yang lain , Anda harus menggunakan tes dua sisi.
Tes Dunn dapat dilakukan di Stata menggunakan dunntest (tipe
net describe dunntest, from(https://www.alexisdinno.com/stata)
), dan di R menggunakan paket dunn.test .Juga, saya bertanya-tanya apakah Anda mungkin mengambil pendekatan analisis kelangsungan hidup untuk menilai apakah dan kapan seekor hewan mati berdasarkan kondisi yang berbeda?
* Beberapa tes paska-hoc yang kurang terkenal untuk mengikuti Kruskal-Wallis yang ditolak, termasuk Conover-Iman (seperti Dunn, tetapi berdasarkan distribusi t , daripada distribusi z , diterapkan untuk Stata dalam paket conovertest , dan untuk R dalam paket conover.test ), dan tes Dwass-Steel-Citchlow-Fligner.
sumber
Generalisasi pemersatu Kruskal-Wallis / Wilcoxon adalah model odds proporsional, yang mengakui kontras umum dengan interval kepercayaan baik secara pointwise atau simultan untuk odds ratio. Ini diimplementasikan dalam
rms
paket R sayaorm
dancontrast.rms
fungsi.sumber
Anda juga dapat menggunakan perbedaan kritis setelah Conover atau perbedaan kritis setelah Schaich dan Hamerle. Yang pertama lebih liberal sedangkan yang kedua tepat tetapi tidak memiliki sedikit kekuatan. Kedua metode diilustrasikan di situs web saya brightstat.com dan webapp brightstat juga memungkinkan Anda menghitung perbedaan kritis ini dan langsung melakukan tes post-hoc. Kruskal-Wallis di brightstat.com
sumber
Jika Anda menggunakan SPSS, lakukan post-hoc Mann-Whitney dengan koreksi Bonferroni (nilai p dibagi dengan jumlah kelompok).
sumber