Bagaimana saya bisa mengatur poisson zero-inflated di JAGS?

12

Saya mencoba mengatur model poisson nol-meningkat di R dan JAGS. Saya baru mengenal JAGS dan saya perlu beberapa panduan tentang cara melakukannya.

Saya sudah mencoba dengan yang berikut ini di mana y [i] adalah variabel yang diamati

model {
for (i in 1:I) {

    y.null[i] <- 0
    y.pois[i] ~ dpois(mu[i])
    pro[i] <- ilogit(theta[i])
    x[i] ~ dbern(pro[i])

    y[i] <- step(2*x[i]-1)*y.pois[i] + (1-step(2*x[i]-1))*y.null[i]

    log(mu[i]) <- bla + bla +bla + ....
    theta[i] <- bla + bla + bla + ....
}

}

Namun ini tidak berfungsi karena Anda tidak dapat menggunakan <- pada variabel yang diamati.

Ada ide bagaimana mengubah / memperbaikinya? Apakah ada cara lain untuk mengatur model poisson zero-inflated di JAGS?

George Michaelides
sumber

Jawaban:

3

Berikut adalah solusi sederhana menggunakan fakta bahwa poisson akan memberi Anda nol ketika parameter lambda nol. Perhatikan bahwa JAGS cenderung pecah jika lambda persis nol, dengan demikian "+ 0,00001".

model {
  for (i in 1:I) {

    y[i] ~ dpois(mu1[i])

    mu1[i] <- mu[i]*x[i] + 0.00001

    x[i] ~ dbern(pro[i])
    logit(pro[i]) <- theta[i]

    mu[i] <- bla + bla +bla + ....
    theta[i] <- bla + bla + bla + ....
  }
nassimhddd
sumber
4
C <- 10000 #Constant 1/0 trick

# Likelihood:
for ( i in 1:ny ) {

#Likelihood of the count model component
LikCountModel[i] <- pow(mu[i],y[i])/y_fact[i]*exp(-mu[i])

#Count model component
eta[i] <- bet0 + inprod( beta[] , B[i,] )
mu[i] <- exp(eta[i])

#ZI Component
zeta[i] <- gamm0 + inprod( gamma[] , G[i,] )
w[i] <- exp(zeta[i])/(1+exp(zeta[i]))

#1/0 Tricks: ones is a column containing only ones, with the same size of y
  p[i] <- L[i] / C
  ones[i] ~ dbern(p[i])

#Full likelihood expression
L[i] <- LikCountModel[i] * (1-w[i]) + equals(y[i],0)*w[i]
}

#then set your priors for all beta and gamma
random_user
sumber