Bagaimana para ilmuwan menghasilkan parameter dan topologi Hidden Markov Model yang benar untuk digunakan?

Saya mengerti bagaimana Model Markov Tersembunyi digunakan dalam sekuens genom, seperti menemukan gen. Tapi saya tidak mengerti bagaimana membuat model Markov tertentu. Maksud saya, berapa banyak negara yang seharusnya dimiliki oleh model? Berapa banyak kemungkinan transisi? Haruskah model memiliki...