Pertanyaan saya ditujukan kepada mereka yang peduli dengan algoritma biologi komputasi. Saya akan mengambil kursus bioinformatika musim gugur ini; Masalahnya, bagaimanapun, adalah bahwa saya memiliki terlalu sedikit latar belakang dalam biologi dan kimia untuk merasa siap untuk siklus lection (saya agak lemah pada mata pelajaran ini di sekolah).
Bisakah Anda merekomendasikan buku apa pun yang akan memberikan pengantar yang bagus untuk pertanyaan-pertanyaan ilmu alam yang berfokus pada bioinformatika?
algorithms
reference-request
education
bioinformatics
Mikhail Dubov
sumber
sumber
Jawaban:
Seperti yang dinyatakan sebelumnya, Anda tidak perlu mempelajari biologi untuk melakukan bioinformatika. Namun, jika Anda ingin memiliki latar belakang pemahaman konsep-konsep dasar seperti gen, RNA, DNA, dll. Maka buku biologi pengantar yang baik harus menyediakan semua yang Anda butuhkan.
Biologi molekuler bukan jenis topik yang bisa kita selami. Oleh karena itu, untuk memahaminya, Anda perlu melakukan beberapa bacaan pengantar. Buku terbaik adalah buku yang memiliki cukup detail tanpa berasumsi bahwa Anda ingin menjadi seorang ahli biologi.
Saya sarankan Anda melihat Collins Outline of College Biology. Membaca bab 2-5 dan 12-15, akan memberi Anda informasi dasar yang Anda inginkan. Pilihan lain adalah Schaum's Outline of Biology, Edisi Ketiga, bab 2-4 dan 7-10. Kedua buku berharga kurang dari $ 20,00 dan mudah dimengerti. Semoga ini membantu.
sumber
Sebagai seseorang yang berasal dari latar belakang ilmu komputer dan memimpin sebuah tim yang mengembangkan produk yang melibatkan bioinformatika, saya dapat bersimpati dengan tantangan untuk mengambil domain - tetapi ini adalah bidang yang menarik untuk dikerjakan.
Seperti yang telah ditunjukkan oleh @JCEHR, bukan merupakan syarat mutlak untuk mempelajari biologi tetapi bermanfaat untuk mulai menjemput beberapa kepala sekolah. Bioinformatika bukan hanya tentang biologi molekuler, sekuensing genom, ekspresi protein dan struktur protein (jangan khawatir jika Anda tidak memahami istilah-istilah ini sekarang), tetapi saya cukup yakin bahwa ini adalah area yang sebagian besar 'bioinformatika tradisional' diterapkan dan akan menjadi inti dari setiap kursus tentang masalah ini. Salah satu fitur terukur yang paling penting dari DNA, RNA dan Protein adalah bahwa mereka adalah string molekul yang dapat diwakili oleh string perangkat lunak - pencarian, penyimpanan, dan pencarian fuzzy string-string tersebut adalah teknik kunci.
Selain primer biologi umum, Anda juga bisa mempertimbangkan untuk melihat buku yang membahas genomik. Berikut ini terlihat bagus tapi agak mahal:
A Primer of Genome Science , oleh Greg Gibson dan Spencer V. Muse
sumber
Sebagai Ilmuwan Komputer yang melakukan minor di bidang Biokimia, rekomendasi saya adalah panduan Kartun Larry Gonick untuk Genetika .
Ini bukan lelucon. Saya tahu beberapa ahli Bioinformatika terhormat yang mempelajari genetika dengan cara ini. Buku ini menjelaskan sebagian besar dari apa, jika bukan segalanya, Anda perlu tahu dan memasok visual paling intuitif untuk membungkus pikiran Anda di sekitar konsep yang mendasarinya. Dan itu menyenangkan dibaca.
sumber
Seperti yang orang lain katakan kepada Anda: itu sedikit tergantung pada buku yang akan Anda gunakan, serta pada topik yang diajarkan. Kadang-kadang akan lebih jelas. Namun agar lebih siap (dan terbiasa dengan terminologi) lihat beberapa primer di web, seperti Preparata: A Biologi Primer untuk Ilmuwan Komputer .
Apakah kita memiliki kolega, atau apakah situs "biostar" adalah tiruan yang ramah? Lihat pertanyaan: " Sumber daya terbaik untuk mempelajari biologi molekuler untuk seorang ilmuwan komputer ".
sumber