Saya mencoba menginstal paket python rpy2dengan pip install di Ubuntu 16.04:

pip install rpy2==2.2.7

tetapi dapatkan pesan kesalahan (lihat hasil lengkap di bawah):

Command "python setup.py egg_info" failed with error code 1 in /tmp/pip-build-EuOI6K/unroll/

Hal yang sama terjadi dengan paket lain, suka pip install unroll, atau menggunakan pip2. Saya pikir posting ini adalah masalah yang sama, tetapi di sana bisa diselesaikan dengan menggunakan sudo.

Solusi dicoba

Aku mencoba solusi dalam posting , seperti: pip install --upgrade setuptools, (sudo) easy_install -U setuptools, atau sudo apt-get install python-setuptools, tetapi tidak berhasil.

info python / pip

Seseorang menyarankan saya mungkin memiliki instalasi python / pip yang aneh, berikut adalah beberapa info:

sudo which python pip pip2 | xargs -rd '\n' readlink -f 
/usr/bin/python2.7   
/usr/local/bin/pip  
/usr/local/bin/pip2  

sudo python --version   
Python 2.7.12  

sudo pip --version  
pip 9.0.1 from /home/matifou/.local/lib/python2.7/site-packages (python 2.7)  
/usr/bin/pip2 --version  
pip 8.1.1 from /usr/lib/python2.7/dist-packages (python 2.7)

ls -l $(which pip); dpkg -S /usr/bin/pip
-rwxr-xr-x 1 root root 204 Nov  8 16:24 /usr/local/bin/pip
python-pip: /usr/bin/pip

Output kesalahan penuh

pip install rpy2 == 2.2.7  
Mengumpulkan rpy2 == 2.2.7 Menggunakan rpy2-2.2.7.tar.gz yang di-cache  
    Output lengkap dari perintah python setup.py egg_info:
    menjalankan egg_info
    membuat pip-egg-info / rpy2.egg-info
    menulis pip-egg-info / rpy2.egg-info / PKG-INFO
    menulis nama tingkat atas ke pip-egg-info / rpy2.egg-info / top_level.txt
    menulis dependency_links ke pip-egg-info / rpy2.egg-info / dependency_links.txt
    menulis file manifes 'pip-egg-info / rpy2.egg-info / SOURCES.txt'
    Traceback (panggilan terakhir terakhir):
      File "", baris 1, dalam 
      File "/tmp/pip-build-EkrbmM/rpy2/setup.py", baris 462, di 
        [os.path.join ('doc', 'source', 'rpy2_logo.png')])],
      File "/usr/lib/python2.7/distutils/core.py", baris 151, dalam pengaturan
        dist.run_commands ()
      File "/usr/lib/python2.7/distutils/dist.py", baris 953, di run_commands
        self.run_command (cmd)
      File "/usr/lib/python2.7/distutils/dist.py", baris 972, di run_command
        cmd_obj.run ()
      File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/setuptools/command/egg_info.py",
baris 280, sedang dijalankan
        self.find_sources ()
      File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/setuptools/command/egg_info.py",
baris 295, di find_sources
        mm.run ()
      File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/setuptools/command/egg_info.py",
baris 526, sedang dijalankan
        self.add_defaults ()
      File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/setuptools/command/egg_info.py",
baris 562, di add_defaults
        sdist.add_defaults (mandiri)
      File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/setuptools/command/py36compat.py",
baris 36, di add_defaults
        self._add_defaults_ext ()
      File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/setuptools/command/py36compat.py",
baris 119, dalam _add_defaults_ext
        build_ext = self.get_finalized_command ('build_ext')
      File "/usr/lib/python2.7/distutils/cmd.py", baris 312, di get_finalized_command
        cmd_obj.ensure_finalized ()
      File "/usr/lib/python2.7/distutils/cmd.py", baris 109, di sure_finalized
        self.finalize_options ()
      File "/tmp/pip-build-EkrbmM/rpy2/setup.py", baris 155, di finalize_options
        config + = get_rconfig (r_home, tentang)
      File "/tmp/pip-build-EkrbmM/rpy2/setup.py", baris 319, di get_rconfig
        rc = RConfig.from_string (rconfig, allow_empty = allow_empty)
      File "/tmp/pip-build-EkrbmM/rpy2/setup.py", baris 279, di from_string
        + '\ nin string \ n' + string)
    ValueError: Substring tidak valid
    -fopenmp
    dalam string
    -Wl, - ekspor-dinamis -fopenmp -Wl, -Bsymbolic-functions -Wl, -z, relro -L / usr / lib / R / lib -lR -lpcre -llzma -lbz2 -lz -lrt -ldl -lm

Perintah "python setup.py egg_info" gagal dengan kode kesalahan 1 di / tmp / pip-build-EkrbmM / rpy2 /

pip instal buka gulungan
Mengumpulkan unroll Menggunakan cached unroll-0.1.0.tar.gz
    Output lengkap dari perintah python setup.py egg_info:
    Mengunduh http://pypi.python.org/packages/source/d/distribute/distribute-0.6.14.tar.gz
    Traceback (panggilan terakhir terakhir):
      File "", baris 1, dalam 
      File "/tmp/pip-build-QimGjp/unroll/setup.py", baris 2, di 
        ez_setup.use_setuptools ()
      File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/ez_setup.py", baris 145, di use_setuptools
        return _do_download (versi, download_base, to_dir, download_delay)
      File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/ez_setup.py", baris 124, di _do_download
        to_dir, download_delay)
      File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/ez_setup.py", baris 193, di download_setuptools
        src = urlopen (url)
      File "/usr/lib/python2.7/urllib2.py", baris 154, di urlopen
        return opener.open (url, data, timeout)
      File "/usr/lib/python2.7/urllib2.py", baris 435, terbuka
        response = meth (req, response)
      File "/usr/lib/python2.7/urllib2.py", baris 548, di http_response
        'http', permintaan, tanggapan, kode, msg, hdrs)
      File "/usr/lib/python2.7/urllib2.py", baris 473, salah
        return self._call_chain (* args)
      File "/usr/lib/python2.7/urllib2.py", baris 407, di _call_chain
        hasil = func (* args)
      File "/usr/lib/python2.7/urllib2.py", baris 556, di http_error_default
        meningkatkan HTTPError (req.get_full_url (), kode, msg, hdrs, fp)
    urllib2.HTTPError: Kesalahan HTTP 403: SSL diperlukan

Perintah "python setup.py egg_info" gagal dengan kode kesalahan 1 di tmp / pip-
build-QimGjp / unroll /

Tingkatkan setuptoolsmenggunakanpip

Versi python-setuptoolsdalam repositori paket Ubuntu 16.04 LTS sudah usang / tidak terawat. Tingkatkan dengan pipbukannya mengandalkan manajer paket:

$ sudo pip install --upgrade setuptools

Solusi yang saya ambil untuk pertanyaan saya sendiri: jawaban yang diajukan tidak menyelesaikan masalah, jadi saya akhirnya menggunakan conda, menciptakan lingkungan spesifik untuk paket yang saya butuhkan, dan ini berhasil! Ini bukan solusi terbaik, terutama karena perlu menginstal versi paralel (Anda dapat menggunakan miniconda untuk ruang) tetapi merupakan solusi praktis!

Memperbarui setuptoolstidak menyelesaikan masalah saya. Namun, memberi tahu pip untuk memutakhirkan sendiri berhasil.

Perintah berikut menyelesaikan masalah saya (dari jawaban ini )

pip install --upgrade pip

Anda perlu mendapatkan alat pengaturan dan mungkin modul dev ketik berikut ini

sudo apt-get install python-setuptools
sudo apt-get install python-dev

Mungkin masuk akal untuk memutakhirkan pip terlebih dahulu untuk memastikan tidak ada yang lain kecuali kelancaran ini dilakukan dengan mengetik

sudo apt install python-pip

semoga berhasil