Setelah menginstal pustaka geos (C ++, dan C), dan kemudian mencoba menginstal paket rgeos (R), ia melaporkan geos-config yang hilang!

9

Mengetahui bahwa paket rgeos, dari bahasa R, membutuhkan instalasi pustaka geos sebelumnya, saya menginstal, keduanya, libgeos dan libgeos-c1 (3.2.2), menggunakan installer sinaptik di mesin Ubuntu 12.04 (32 bit) saya.

Kemudian saya mencoba menginstal rgeos langsung dari konsol R, dan mengeluarkan pesan dalam arti bahwa geos-config tidak ditemukan. Outputnya adalah sebagai berikut:

> install.packages("rgeos")
Installing package(s) into ‘/home/checo/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.15’
(as ‘lib’ is unspecified)
also installing the dependency ‘sp’

probando la URL 'http://cran.rstudio.com/src/contrib/sp_1.0-9.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 882102 bytes (861 Kb)
URL abierta
==================================================
downloaded 861 Kb

probando la URL 'http://cran.rstudio.com/src/contrib/rgeos_0.2-19.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 221471 bytes (216 Kb)
URL abierta
==================================================
downloaded 216 Kb

* installing *source* package ‘sp’ ...
** package ‘sp’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** libs
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c R    centroid.c -o Rcentroid.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c gcdist.c -o gcdist.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c init.c -o init.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c pip.c -o pip.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c pip2.c -o pip2.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c sp_xports.c -o sp_xports.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c surfaceArea.c -o surfaceArea.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c zerodist.c -o zerodist.o
gcc -std=gnu99 -shared -o sp.so Rcentroid.o gcdist.o init.o pip.o pip2.o sp_xports.o surfaceArea.o zerodist.o -L/usr/lib/R/lib -lR
installing to /home/checo/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.15/sp/libs
** R
** data
** demo
** inst
** preparing package for lazy loading
** help
*** installing help indices
** building package indices
** installing vignettes
   ‘intro_sp.Rnw’ 
   ‘over.Rnw’ 
** testing if installed package can be loaded

* DONE (sp)
* installing *source* package ‘rgeos’ ...
** package ‘rgeos’ successfully unpacked and MD5 sums checked
configure: CC: gcc -std=gnu99
configure: CXX: g++
configure: rgeos: 0.2-17
checking for /usr/bin/svnversion... no
configure: svn revision: 394
checking geos-config usability... 
./configure: line 1385: geos-config: command not found
no
configure: error: geos-config not usable
ERROR: configuration failed for package ‘rgeos’
* removing ‘/home/checo/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.15/rgeos’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘rgeos’ had non-zero exit status

Maafkan ketidaktahuan saya, tapi saya tidak tahu dari mana file ini, "geos-config", berasal: apakah itu harus dihasilkan oleh kompilasi gcc di atas, atau haruskah itu diinstal sebelumnya ketika perpustakaan libgeos di-instal?

Saya belajar, dari komputer lain, bahwa "geos-config" adalah executable dan harus diinstal di / usr / bin.

Apakah Anda tahu apa yang salah dengan prosedur saya?

Terima kasih,

-Sergio.

JulioSergio
sumber

Jawaban:

14

Instal paket libgeos-devInstal libgeos-dev dengan manajer paket favorit Anda (atau pusat perangkat lunak) dan Anda akan memilikinya /usr/bin/geos-config.

Bagaimana saya menemukan ini? Saya menggunakan kueri geos-configuntuk file di http://packages.ubuntu.com/ halaman web. Ini akan mencantumkan paket yang Anda butuhkan ( tautan permintaan ). Gunakan ini lain kali ketika Anda mengalami masalah serupa!

gertvdijk
sumber
2
Anda juga dapat menggunakan alat yang bagus apt-fileuntuk mencari file di repo ubuntu. Misalnya. apt-file search geos-configakan memberi Anda pencocokan yang tepat untuk libgeos-dev.
ortang
Terima kasih! Saya melakukan seperti yang Anda rekomendasikan, dan paket R "rgeos" juga dipasang tanpa masalah.
JulioSergio
2

Karena OP tidak menyebutkan distribusi tertentu, ini adalah baris yang saya perlukan untuk menginstal go-config pada CENTOS (mis., RHEL & Amazon Linux): yum install -y geos-devel

D. Woods
sumber