Kebocoran memori yang tak terlihat di Linux - Server Ubuntu (bukan cache disk / buffer!)

23

Ringkasan Agustus 2015

Harap dicatat, ini masih terjadi. Ini tidak terkait dengan linuxatemyram.com - memori tidak digunakan untuk cache disk / buffer. Ini seperti di NewRelic - sistem bocor semua memori, menggunakan semua ruang swap dan kemudian crash. Dalam tangkapan layar ini saya me-reboot server sebelum crash:

masukkan deskripsi gambar di sini

Tidak mungkin mengidentifikasi sumber kebocoran menggunakan alat userspace yang umum. Sekarang ada ruang obrolan untuk membahas masalah ini: http://chat.stackexchange.com/rooms/27309/invisible-memory-leak-on-linux

Satu-satunya cara untuk memulihkan memori yang "hilang" tampaknya me-reboot server. Ini telah menjadi masalah lama yang direproduksi di Ubuntu Server 14.04, 14.10 dan 15.04.

Teratas

Penggunaan memori tidak muncul di atas dan tidak dapat dipulihkan bahkan setelah membunuh hampir setiap proses (tidak termasuk hal-hal seperti proses kernel dan ssh). Lihatlah bidang "cached Mem", "buffer" dan "gratis" di atas, mereka tidak menggunakan memori, memori yang digunakan adalah "hilang" dan tidak dapat dipulihkan tanpa reboot.

Mencoba menggunakan memori "hilang" ini menyebabkan server bertukar, memperlambat perayapan, dan akhirnya membeku.

root@XanBox:~# top -o +%MEM
top - 12:12:13 up 15 days, 20:39,  3 users,  load average: 0.00, 0.06, 0.77
Tasks: 126 total,   1 running, 125 sleeping,   0 stopped,   0 zombie
%Cpu(s):  0.1 us,  0.2 sy,  0.0 ni, 99.7 id,  0.0 wa,  0.1 hi,  0.0 si,  0.0 st
KiB Mem:   2,040,256 total,  1,881,228 used,    159,028 free,     1,348 buffers
KiB Swap:  1,999,868 total,     27,436 used,  1,972,432 free.    67,228 cached Mem

  PID USER      PR  NI    VIRT    RES    SHR S  %CPU %MEM     TIME+ COMMAND
11502 root      20   0  107692   4252   3240 S   0.0  0.2   0:00.06 sshd: deployer [priv]
11336 root      20   0  107692   4248   3240 S   0.0  0.2   0:00.06 sshd: deployer [priv]
11841 root      20   0  107692   4248   3240 S   0.0  0.2   0:00.06 sshd: deployer [priv]
11301 root      20   0   26772   3436   2688 S   0.7  0.2   0:01.30 /usr/sbin/openvpn --writepid /var/run/openvpn.zanview.com.pid --status /var/run/openvpn.zanview.com.status 10 --cd /etc/openvpn --config /etc/openvpn/z+
11385 deployer  20   0   19972   2392   1708 S   0.0  0.1   0:00.03 -bash
11553 deployer  20   0   19972   2388   1708 S   0.0  0.1   0:00.03 -bash
11890 deployer  20   0   19972   2388   1708 S   0.0  0.1   0:00.02 -bash
11889 deployer  20   0  108008   2280    944 S   0.0  0.1   0:00.25 sshd: deployer@pts/3
12009 root      20   0   18308   2228   1608 S   0.0  0.1   0:00.09 -su
12114 root      20   0   18308   2192   1564 S   0.0  0.1   0:00.04 -su
12007 root      20   0   67796   2136   1644 S   0.0  0.1   0:00.01 sudo su -
12112 root      20   0   67796   2136   1644 S   0.0  0.1   0:00.01 sudo su -
12008 root      20   0   67376   2016   1528 S   0.0  0.1   0:00.01 su -
12113 root      20   0   67376   2012   1528 S   0.0  0.1   0:00.01 su -
    1 root      20   0   33644   1988    764 S   0.0  0.1   2:29.77 /sbin/init
11552 deployer  20   0  107692   1952    936 S   0.0  0.1   0:00.07 sshd: deployer@pts/2
11384 deployer  20   0  107692   1948    936 S   0.0  0.1   0:00.06 sshd: deployer@pts/0
12182 root      20   0   20012   1516   1012 R   0.7  0.1   0:00.08 top -o +%MEM
 1152 message+  20   0   39508   1448    920 S   0.0  0.1   1:40.01 dbus-daemon --system --fork
 1791 root      20   0  279832   1312    816 S   0.0  0.1   1:16.18 /usr/lib/policykit-1/polkitd --no-debug
 1186 root      20   0   43736    984    796 S   0.0  0.0   1:13.07 /lib/systemd/systemd-logind
 1212 syslog    20   0  256228    688    184 S   0.0  0.0   1:41.29 rsyslogd
 5077 root      20   0   25324    648    520 S   0.0  0.0   0:34.35 /usr/sbin/hostapd -B -P /var/run/hostapd.pid /etc/hostapd/hostapd.conf
  336 root      20   0   19476    512    376 S   0.0  0.0   0:07.40 upstart-udev-bridge --daemon
  342 root      20   0   51228    468    344 S   0.0  0.0   0:00.85 /lib/systemd/systemd-udevd --daemon
 1097 root      20   0   15276    364    256 S   0.0  0.0   0:06.39 upstart-file-bridge --daemon
 4921 root      20   0   61364    364    240 S   0.0  0.0   0:00.05 /usr/sbin/sshd -D
  745 root      20   0   15364    252    180 S   0.0  0.0   0:06.51 upstart-socket-bridge --daemon
 4947 root      20   0   23656    168    100 S   0.0  0.0   0:14.70 cron
11290 daemon    20   0   19140    164      0 S   0.0  0.0   0:00.00 atd
  850 root      20   0   23420     80     16 S   0.0  0.0   0:11.00 rpcbind
  872 statd     20   0   21544      8      4 S   0.0  0.0   0:00.00 rpc.statd -L
 4880 root      20   0   14540      4      0 S   0.0  0.0   0:00.00 /sbin/getty -8 38400 tty4
 4883 root      20   0   14540      4      0 S   0.0  0.0   0:00.00 /sbin/getty -8 38400 tty5
 4890 root      20   0   14540      4      0 S   0.0  0.0   0:00.00 /sbin/getty -8 38400 tty2
 4891 root      20   0   14540      4      0 S   0.0  0.0   0:00.00 /sbin/getty -8 38400 tty3
 4894 root      20   0   14540      4      0 S   0.0  0.0   0:00.00 /sbin/getty -8 38400 tty6
 4919 root      20   0    4368      4      0 S   0.0  0.0   0:00.00 acpid -c /etc/acpi/events -s /var/run/acpid.socket
 5224 root      20   0   24048      4      0 S   0.0  0.0   0:00.00 /usr/sbin/rpc.mountd --manage-gids
 6160 root      20   0   14540      4      0 S   0.0  0.0   0:00.00 /sbin/getty -8 38400 tty1
    2 root      20   0       0      0      0 S   0.0  0.0   0:03.44 [kthreadd]
    3 root      20   0       0      0      0 S   0.0  0.0   1:04.63 [ksoftirqd/0]
    5 root       0 -20       0      0      0 S   0.0  0.0   0:00.00 [kworker/0:0H]
    7 root      20   0       0      0      0 S   0.0  0.0  16:03.32 [rcu_sched]
    8 root      20   0       0      0      0 S   0.0  0.0   4:08.79 [rcuos/0]
    9 root      20   0       0      0      0 S   0.0  0.0   4:10.42 [rcuos/1]
   10 root      20   0       0      0      0 S   0.0  0.0   4:30.71 [rcuos/2]

Perangkat keras

Saya telah mengamati ini pada 3 server dari sekitar 100 sejauh ini (meskipun yang lain mungkin terpengaruh). Salah satunya adalah Intel Atom D525 @ 1.8ghz dan 2 lainnya adalah Core2Duo E4600 dan Q6600. Salah satunya adalah menggunakan JMicron Technology Corp. JMC250 PCI Express Gigabit Ethernet Controller, yang lain menggunakan Qualcomm Atheros Attansic L1 Gigabit Ethernet (rev b0).

Saya menjalankan lshw pada server masalah dan juga pada contoh server OK. Server Masalah: http://pastie.org/10370534 http://pastie.org/10370537 dan http://pastie.org/10370541 - OK Server: http://pastie.org/10370544

Aplikasi

Ini adalah aplikasi yang sepenuhnya tanpa kepala. Tidak ada monitor yang terhubung dan sebenarnya tidak ada XServer yang terpasang sama sekali. Ini harus mengesampingkan driver grafis / masalah.

Server digunakan untuk proksi dan menganalisis video RTSP menggunakan live555ProxyServer, ffmpeg dan openCV. Server-server ini melakukan banyak traffic karena ini adalah aplikasi CCTV: http://pastie.org/9558324

Saya telah mencoba versi trunk yang sangat lama dan terbaru dari live555, ffmpeg dan openCV tanpa perubahan. Saya juga telah mencoba menggunakan opencv melalui modul python2 dan python3, tidak ada perubahan.

Perangkat lunak / konfigurasi yang sama persis telah dimuat ke dekat dengan 100 server, sejauh ini 3 dipastikan bocor memori. Server perlahan dan diam-diam bocor di sekitar xMB (satu bocor 8MB, satu lebih lambat, satu lebih cepat) per jam sampai semua ram hilang, server mulai bertukar banyak, lambat untuk merangkak dan membutuhkan reboot.

Meminfo

Sekali lagi, Anda dapat melihat Cached dan Buffer tidak menggunakan banyak memori sama sekali. HugePages juga dinonaktifkan sehingga ini bukan pelakunya.

root@XanBox:~# cat /proc/meminfo
MemTotal:          2,040,256 kB
MemFree:             159,004 kB
Buffers:               1,348 kB
Cached:               67,228 kB
SwapCached:            9,940 kB
Active:               10,788 kB
Inactive:             81,120 kB
Active(anon):          1,900 kB
Inactive(anon):       21,512 kB
Active(file):          8,888 kB
Inactive(file):       59,608 kB
Unevictable:               0 kB
Mlocked:                   0 kB
SwapTotal:         1,999,868 kB
SwapFree:          1,972,432 kB
Dirty:                     0 kB
Writeback:                 0 kB
AnonPages:            14,496 kB
Mapped:                8,160 kB
Shmem:                    80 kB
Slab:                 33,472 kB
SReclaimable:         17,660 kB
SUnreclaim:           15,812 kB
KernelStack:           1,064 kB
PageTables:            3,992 kB
NFS_Unstable:              0 kB
Bounce:                    0 kB
WritebackTmp:              0 kB
CommitLimit:       3,019,996 kB
Committed_AS:         94,520 kB
VmallocTotal: 34,359,738,367 kB
VmallocUsed:         535,936 kB
VmallocChunk: 34,359,147,772 kB
HardwareCorrupted:         0 kB
AnonHugePages:             0 kB
HugePages_Total:           0
HugePages_Free:            0
HugePages_Rsvd:            0
HugePages_Surp:            0
Hugepagesize:          2,048 kB
DirectMap4k:          62,144 kB
DirectMap2M:       2,025,472 kB

Output Gratis

Gratis menunjukkan yang berikut (catatan cache dan buffer keduanya rendah sehingga ini bukan cache disk atau buffer!) - memori tidak dapat dipulihkan tanpa reboot: 

root@XanBox:~# free -m
             total       used       free     shared    buffers     cached
Mem:         1,992      1,838        153          0          1         66

Jika kita mengurangi / menambahkan buffer / cache ke Digunakan dan Gratis, kita melihat:

  • 1,772MB Really Used (- Buffer / Cache) = 1,838MB digunakan - Buffer 1MB - 66MB cache
  • 220MB Benar-benar Gratis (+ Buffer / Cache) = 154MB gratis + 1MB buffer + 66MB cache

Persis seperti yang kita harapkan:

-/+ buffers/cache:      1,772        220

Jadi sekitar 1.7GB tidak digunakan oleh userspace dan pada kenyataannya digunakan oleh kernel karena sistem sebenarnya menggunakan 53.7MB (lihat output PS Mem di bawah).

Saya terkejut dengan jumlah komentar yang berpikir 1.7GB digunakan untuk caching / buffer - ini pada dasarnya salah membaca output! - baris ini berarti memori yang digunakan tidak termasuk buffer / cache , lihat linuxatemyram.com untuk detailnya.

Output PS

Berikut adalah daftar lengkap proses yang berjalan yang diurutkan berdasarkan memori:

# ps -e -o pid,vsz,comm= | sort -n -k 2
    2      0 kthreadd
    3      0 ksoftirqd/0
    5      0 kworker/0:0H
    7      0 rcu_sched
    8      0 rcuos/0
    9      0 rcuos/1
   10      0 rcuos/2
   11      0 rcuos/3
   12      0 rcu_bh
   13      0 rcuob/0
   14      0 rcuob/1
   15      0 rcuob/2
   16      0 rcuob/3
   17      0 migration/0
   18      0 watchdog/0
   19      0 watchdog/1
   20      0 migration/1
   21      0 ksoftirqd/1
   23      0 kworker/1:0H
   24      0 watchdog/2
   25      0 migration/2
   26      0 ksoftirqd/2
   28      0 kworker/2:0H
   29      0 watchdog/3
   30      0 migration/3
   31      0 ksoftirqd/3
   32      0 kworker/3:0
   33      0 kworker/3:0H
   34      0 khelper
   35      0 kdevtmpfs
   36      0 netns
   37      0 writeback
   38      0 kintegrityd
   39      0 bioset
   41      0 kblockd
   42      0 ata_sff
   43      0 khubd
   44      0 md
   45      0 devfreq_wq
   46      0 kworker/0:1
   47      0 kworker/1:1
   48      0 kworker/2:1
   50      0 khungtaskd
   51      0 kswapd0
   52      0 ksmd
   53      0 khugepaged
   54      0 fsnotify_mark
   55      0 ecryptfs-kthrea
   56      0 crypto
   68      0 kthrotld
   70      0 scsi_eh_0
   71      0 scsi_eh_1
   92      0 deferwq
   93      0 charger_manager
   94      0 kworker/1:2
   95      0 kworker/3:2
  149      0 kpsmoused
  155      0 jbd2/sda1-8
  156      0 ext4-rsv-conver
  316      0 jbd2/sda3-8
  317      0 ext4-rsv-conver
  565      0 kmemstick
  770      0 cfg80211
  818      0 hd-audio0
  853      0 kworker/2:2
  953      0 rpciod
  PID    VSZ
 1714      0 kauditd
11335      0 kworker/0:2
12202      0 kworker/u8:2
20228      0 kworker/u8:0
25529      0 kworker/u9:1
28305      0 kworker/u9:2
29822      0 lockd
 4919   4368 acpid
 4074   7136 ps
 6681  10232 dhclient
 4880  14540 getty
 4883  14540 getty
 4890  14540 getty
 4891  14540 getty
 4894  14540 getty
 6160  14540 getty
14486  15260 upstart-socket-
14489  15276 upstart-file-br
12009  18308 bash
12114  18308 bash
12289  18308 bash
 4075  19008 sort
11290  19140 atd
14483  19476 upstart-udev-br
11385  19972 bash
11553  19972 bash
11890  19972 bash
29503  21544 rpc.statd
 2847  23384 htop
  850  23420 rpcbind
29588  23480 rpc.idmapd
 4947  23656 cron
29833  24048 rpc.mountd
 5077  25324 hostapd
11301  26912 openvpn
    1  37356 init
 1152  39508 dbus-daemon
14673  43452 systemd-logind
14450  51204 systemd-udevd
 4921  61364 sshd
12008  67376 su
12113  67376 su
12288  67376 su
12007  67796 sudo
12112  67796 sudo
12287  67796 sudo
11336 107692 sshd
11384 107692 sshd
11502 107692 sshd
11841 107692 sshd
11552 108008 sshd
11889 108008 sshd
 1212 256228 rsyslogd
 1791 279832 polkitd
 4064 335684 whoopsie

Berikut adalah daftar lengkap semua proses yang berjalan:

root@XanBox:~# ps aux
USER       PID %CPU %MEM    VSZ   RSS TTY      STAT START   TIME COMMAND
root         1  0.0  0.0  33644  1988 ?        Ss   Jul21   2:29 /sbin/init
root         2  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:03 [kthreadd]
root         3  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   1:04 [ksoftirqd/0]
root         5  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [kworker/0:0H]
root         7  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21  16:03 [rcu_sched]
root         8  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   4:08 [rcuos/0]
root         9  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   4:10 [rcuos/1]
root        10  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   4:30 [rcuos/2]
root        11  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   4:28 [rcuos/3]
root        12  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:00 [rcu_bh]
root        13  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:00 [rcuob/0]
root        14  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:00 [rcuob/1]
root        15  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:00 [rcuob/2]
root        16  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:00 [rcuob/3]
root        17  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:13 [migration/0]
root        18  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:08 [watchdog/0]
root        19  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:07 [watchdog/1]
root        20  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:13 [migration/1]
root        21  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   1:03 [ksoftirqd/1]
root        23  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [kworker/1:0H]
root        24  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:07 [watchdog/2]
root        25  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:23 [migration/2]
root        26  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   1:01 [ksoftirqd/2]
root        28  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [kworker/2:0H]
root        29  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:07 [watchdog/3]
root        30  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:23 [migration/3]
root        31  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   1:03 [ksoftirqd/3]
root        32  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:00 [kworker/3:0]
root        33  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [kworker/3:0H]
root        34  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [khelper]
root        35  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:00 [kdevtmpfs]
root        36  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [netns]
root        37  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [writeback]
root        38  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [kintegrityd]
root        39  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [bioset]
root        41  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [kblockd]
root        42  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [ata_sff]
root        43  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:00 [khubd]
root        44  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [md]
root        45  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [devfreq_wq]
root        46  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21  18:51 [kworker/0:1]
root        47  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:00 [kworker/1:1]
root        48  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   1:14 [kworker/2:1]
root        50  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:01 [khungtaskd]
root        51  0.4  0.0      0     0 ?        S    Jul21  95:51 [kswapd0]
root        52  0.0  0.0      0     0 ?        SN   Jul21   0:00 [ksmd]
root        53  0.0  0.0      0     0 ?        SN   Jul21   0:28 [khugepaged]
root        54  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:00 [fsnotify_mark]
root        55  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:00 [ecryptfs-kthrea]
root        56  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [crypto]
root        68  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [kthrotld]
root        70  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:00 [scsi_eh_0]
root        71  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:00 [scsi_eh_1]
root        92  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [deferwq]
root        93  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [charger_manager]
root        94  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   1:05 [kworker/1:2]
root        95  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   1:08 [kworker/3:2]
root       149  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [kpsmoused]
root       155  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   3:39 [jbd2/sda1-8]
root       156  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [ext4-rsv-conver]
root       316  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   1:28 [jbd2/sda3-8]
root       317  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [ext4-rsv-conver]
root       336  0.0  0.0  19476   512 ?        S    Jul21   0:07 upstart-udev-bridge --daemon
root       342  0.0  0.0  51228   468 ?        Ss   Jul21   0:00 /lib/systemd/systemd-udevd --daemon
root       565  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [kmemstick]
root       745  0.0  0.0  15364   252 ?        S    Jul21   0:06 upstart-socket-bridge --daemon
root       770  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [cfg80211]
root       818  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [hd-audio0]
root       850  0.0  0.0  23420    80 ?        Ss   Jul21   0:11 rpcbind
root       853  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:00 [kworker/2:2]
statd      872  0.0  0.0  21544     8 ?        Ss   Jul21   0:00 rpc.statd -L
root       953  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [rpciod]
root      1097  0.0  0.0  15276   364 ?        S    Jul21   0:06 upstart-file-bridge --daemon
message+  1152  0.0  0.0  39508  1448 ?        Ss   Jul21   1:40 dbus-daemon --system --fork
root      1157  0.0  0.0  23480     0 ?        Ss   Jul21   0:00 rpc.idmapd
root      1186  0.0  0.0  43736   984 ?        Ss   Jul21   1:13 /lib/systemd/systemd-logind
syslog    1212  0.0  0.0 256228   688 ?        Ssl  Jul21   1:41 rsyslogd
root      1714  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:00 [kauditd]
root      1791  0.0  0.0 279832  1312 ?        Sl   Jul21   1:16 /usr/lib/policykit-1/polkitd --no-debug
root      4880  0.0  0.0  14540     4 tty4     Ss+  Jul21   0:00 /sbin/getty -8 38400 tty4
root      4883  0.0  0.0  14540     4 tty5     Ss+  Jul21   0:00 /sbin/getty -8 38400 tty5
root      4890  0.0  0.0  14540     4 tty2     Ss+  Jul21   0:00 /sbin/getty -8 38400 tty2
root      4891  0.0  0.0  14540     4 tty3     Ss+  Jul21   0:00 /sbin/getty -8 38400 tty3
root      4894  0.0  0.0  14540     4 tty6     Ss+  Jul21   0:00 /sbin/getty -8 38400 tty6
root      4919  0.0  0.0   4368     4 ?        Ss   Jul21   0:00 acpid -c /etc/acpi/events -s /var/run/acpid.socket
root      4921  0.0  0.0  61364   364 ?        Ss   Jul21   0:00 /usr/sbin/sshd -D
root      4947  0.0  0.0  23656   168 ?        Ss   Jul21   0:14 cron
root      5077  0.0  0.0  25324   648 ?        Ss   Jul21   0:34 /usr/sbin/hostapd -B -P /var/run/hostapd.pid /etc/hostapd/hostapd.conf
root      5192  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:00 [lockd]
root      5224  0.0  0.0  24048     4 ?        Ss   Jul21   0:00 /usr/sbin/rpc.mountd --manage-gids
root      6160  0.0  0.0  14540     4 tty1     Ss+  Jul21   0:00 /sbin/getty -8 38400 tty1
root      6681  0.0  0.0  10232     0 ?        Ss   11:07   0:00 dhclient -1 -v -pf /run/dhclient.eth0.pid -lf /var/lib/dhcp/dhclient.eth0.leases eth0
root      9452  0.0  0.0      0     0 ?        S    11:28   0:00 [kworker/u8:1]
root      9943  0.0  0.0      0     0 ?        S    11:42   0:00 [kworker/u8:0]
daemon   11290  0.0  0.0  19140   164 ?        Ss   11:59   0:00 atd
root     11301  0.2  0.1  26772  3436 ?        Ss   12:00   0:01 /usr/sbin/openvpn --writepid /var/run/openvpn.zanview.com.pid --status /var/run/openvpn.zanview.com.status 10 --cd /etc/openvpn --config /etc/openvpn/zanvie
root     11335  0.0  0.0      0     0 ?        S    12:01   0:00 [kworker/0:2]
root     11336  0.0  0.2 107692  4248 ?        Ss   12:01   0:00 sshd: deployer [priv]
deployer 11384  0.0  0.0 107692  1948 ?        S    12:01   0:00 sshd: deployer@pts/0
deployer 11385  0.0  0.1  19972  2392 pts/0    Ss+  12:01   0:00 -bash
root     11502  0.0  0.2 107692  4252 ?        Ss   12:01   0:00 sshd: deployer [priv]
deployer 11552  0.0  0.0 107692  1952 ?        S    12:01   0:00 sshd: deployer@pts/2
deployer 11553  0.0  0.1  19972  2388 pts/2    Ss   12:01   0:00 -bash
root     11841  0.0  0.2 107692  4248 ?        Ss   12:02   0:00 sshd: deployer [priv]
deployer 11889  0.0  0.1 108008  2280 ?        S    12:02   0:00 sshd: deployer@pts/3
deployer 11890  0.0  0.1  19972  2388 pts/3    Ss   12:02   0:00 -bash
root     12007  0.0  0.1  67796  2136 pts/3    S    12:02   0:00 sudo su -
root     12008  0.0  0.0  67376  2016 pts/3    S    12:02   0:00 su -
root     12009  0.0  0.1  18308  2228 pts/3    S+   12:02   0:00 -su
root     12112  0.0  0.1  67796  2136 pts/2    S    12:08   0:00 sudo su -
root     12113  0.0  0.0  67376  2012 pts/2    S    12:08   0:00 su -
root     12114  0.0  0.1  18308  2192 pts/2    S    12:08   0:00 -su
root     12180  0.0  0.0  15568  1160 pts/2    R+   12:09   0:00 ps aux
root     25529  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul28   0:09 [kworker/u9:1]
root     28305  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Aug05   0:00 [kworker/u9:2]

Keluaran PS Mem

Saya juga mencoba ps_mem.py dari https://github.com/pixelb/ps_mem

root@XanBox:~/ps_mem# python ps_mem.py
 Private  +   Shared  =  RAM used   Program

144.0 KiB +   9.5 KiB = 153.5 KiB   acpid
172.0 KiB +  29.5 KiB = 201.5 KiB   atd
248.0 KiB +  35.0 KiB = 283.0 KiB   cron
272.0 KiB +  84.0 KiB = 356.0 KiB   upstart-file-bridge
276.0 KiB +  84.5 KiB = 360.5 KiB   upstart-socket-bridge
280.0 KiB + 102.5 KiB = 382.5 KiB   upstart-udev-bridge
332.0 KiB +  54.5 KiB = 386.5 KiB   rpc.idmapd
368.0 KiB +  91.5 KiB = 459.5 KiB   rpcbind
388.0 KiB + 251.5 KiB = 639.5 KiB   systemd-logind
668.0 KiB +  43.5 KiB = 711.5 KiB   hostapd
576.0 KiB + 157.5 KiB = 733.5 KiB   systemd-udevd
676.0 KiB +  65.5 KiB = 741.5 KiB   rpc.mountd
604.0 KiB + 163.0 KiB = 767.0 KiB   rpc.statd
908.0 KiB +  62.5 KiB = 970.5 KiB   dbus-daemon [updated]
932.0 KiB + 117.0 KiB =   1.0 MiB   getty [updated] (6)
  1.0 MiB +  69.5 KiB =   1.1 MiB   openvpn
  1.0 MiB + 137.0 KiB =   1.2 MiB   polkitd
  1.5 MiB + 202.0 KiB =   1.7 MiB   htop
  1.4 MiB + 306.5 KiB =   1.7 MiB   whoopsie
  1.4 MiB + 279.0 KiB =   1.7 MiB   su (3)
  1.5 MiB + 268.5 KiB =   1.8 MiB   sudo (3)
  2.2 MiB +  11.5 KiB =   2.3 MiB   dhclient
  3.9 MiB + 741.0 KiB =   4.6 MiB   bash (6)
  5.3 MiB + 254.5 KiB =   5.5 MiB   init
  2.7 MiB +   3.3 MiB =   6.1 MiB   sshd (7)
 18.1 MiB +  56.5 KiB =  18.2 MiB   rsyslogd
---------------------------------
                         53.7 MiB
=================================

Output Slabtop

Saya juga mencoba slabtop:

root@XanBox:~# slabtop -sc
 Active / Total Objects (% used)    : 131306 / 137558 (95.5%)
 Active / Total Slabs (% used)      : 3888 / 3888 (100.0%)
 Active / Total Caches (% used)     : 63 / 105 (60.0%)
 Active / Total Size (% used)       : 27419.31K / 29580.53K (92.7%)
 Minimum / Average / Maximum Object : 0.01K / 0.21K / 8.00K

  OBJS ACTIVE  USE OBJ SIZE  SLABS OBJ/SLAB CACHE SIZE NAME
  8288   7975  96%    0.57K    296       28      4736K inode_cache
 14259  12858  90%    0.19K    679       21      2716K dentry
  2384   1943  81%    0.96K    149       16      2384K ext4_inode_cache
 20916  20494  97%    0.11K    581       36      2324K sysfs_dir_cache
   624    554  88%    2.00K     39       16      1248K kmalloc-2048
   195    176  90%    5.98K     39        5      1248K task_struct
  6447   6387  99%    0.19K    307       21      1228K kmalloc-192
  2128   1207  56%    0.55K     76       28      1216K radix_tree_node
   768    761  99%    1.00K     48       16       768K kmalloc-1024
   176    155  88%    4.00K     22        8       704K kmalloc-4096
  1100   1100 100%    0.63K     44       25       704K proc_inode_cache
  1008   1008 100%    0.66K     42       24       672K shmem_inode_cache
  2640   2262  85%    0.25K    165       16       660K kmalloc-256
   300    300 100%    2.06K     20       15       640K sighand_cache
  5967   5967 100%    0.10K    153       39       612K buffer_head
  1152   1053  91%    0.50K     72       16       576K kmalloc-512
  3810   3810 100%    0.13K    127       30       508K ext4_allocation_context
    60     60 100%    8.00K     15        4       480K kmalloc-8192
   225    225 100%    2.06K     15       15       480K idr_layer_cache
  7616   7324  96%    0.06K    119       64       476K kmalloc-64
   700    700 100%    0.62K     28       25       448K sock_inode_cache
   252    252 100%    1.75K     14       18       448K TCP
  8925   8544  95%    0.05K    105       85       420K shared_policy_node
  3072   2351  76%    0.12K     96       32       384K kmalloc-128
   360    360 100%    1.06K     12       30       384K signal_cache
   432    337  78%    0.88K     24       18       384K mm_struct

Lain

Saya juga mencoba memindai rootkit dengan rkhunter - tidak menemukan apa pun. Dan saya mencoba menyinkronkan dan membuang cache dengan:

sync; sync; sync; echo 3 > /proc/sys/vm/drop_caches

Tidak ada bedanya juga.

Saya juga mencoba memaksa swap atau menonaktifkan swap dengan:

sudo sysctl -w vm.swappiness=100
sudo swapoff /dev/sda2

Saya juga mencoba menggunakan htop dan menyortir berdasarkan memori dan tidak menunjukkan ke mana memori akan pergi. Versi kernel adalah Linux 3.13.0-40-generik # 69-Ubuntu SMP.

Output Dmesg: http://pastie.org/9558255 output smem: http://pastie.org/9558290

Kesimpulan

Apa yang sedang terjadi? - Di mana semua memori pergi? - Bagaimana saya mengetahuinya?

linux ubuntu memory Hackeron
sumber
2
kemungkinan duplikat Linux: cari tahu proses apa yang menggunakan semua RAM?
Colin Pickard
Anda salah membaca output - IO caching hanya 65, bukan 1771 ...
Hackeron
1
@ user50300: linuxnix.com/2013/05/find-ram-size-in-linuxunix.html Mem digunakan - (buffer + cache) = ram yang digunakan oleh aplikasi.
Frank Thomas
@ FrankThomas Saya sudah mencoba semua itu, baca pertanyaan saya lebih hati-hati.
Hackeron
2
Cobalah untuk melihat apakah beberapa proses tidak melepaskan memori dengan benar:sync && sudo echo 3 > /proc/sys/vm/drop_caches
Hastur

Jawaban:

7

Kesimpulan saya adalah itu adalah kebocoran memori kernel di suatu tempat di kernel Linux, ini sebabnya tidak ada alat userspace yang dapat menunjukkan di mana memori bocor. Mungkin itu terkait dengan pertanyaan ini: /server/670423/linux-memory-usage-higher-than-sum-of-processes

Saya memutakhirkan versi kernel dari 3.13 ke 3.19 dan sepertinya kebocoran memori telah berhenti! - Saya akan melaporkan kembali jika saya melihat kebocoran lagi.

Masih berguna untuk memiliki beberapa cara yang mudah / lebih mudah untuk melihat berapa banyak memori yang digunakan untuk berbagai bagian dari kernel Linux. Masih menjadi misteri apa yang menyebabkan kebocoran di 3.13.

Hackeron
sumber
2

Cerita

Saya dapat mereproduksi masalah Anda menggunakan ZFS di Linux .

Berikut adalah server yang disebut node51dengan 20GBRAM. Saya menandai 16GiBRAM agar dapat dialokasikan ke cache pengganti adaptif (ARC) ZFS :

root@node51 [~]# echo 17179869184 > /sys/module/zfs/parameters/zfs_arc_max
root@node51 [~]# grep c_max /proc/spl/kstat/zfs/arcstats
c_max                           4    17179869184

Lalu, saya membaca 45GiBfile menggunakan Pipe Viewer di kumpulan ZFS saya zeltikuntuk mengisi ARC:

root@node51 [~]# pv /zeltik/backup-backups/2014.04.11.squashfs > /dev/zero
  45GB 0:01:20 [ 575MB/s] [==================================>] 100%

Sekarang lihat memori bebas:

root@node51 [~]# free -m
             total       used       free     shared    buffers     cached
Mem:         20013      19810        203          1         51         69
-/+ buffers/cache:      19688        324
Swap:         7557          0       7556

Melihat!

51MiBdalam buffer
69MiBdalam cache
120MiBdi kedua
19688MiBRAM yang digunakan, termasuk buffer dan cache
19568MiBRAM yang digunakan, tidak termasuk buffer dan cache

Skrip Python yang Anda referensikan melaporkan bahwa aplikasi hanya menggunakan sejumlah kecil RAM:

root@node51 [~]# python ps_mem.py
 Private  +   Shared  =  RAM used       Program

148.0 KiB +  54.0 KiB = 202.0 KiB       acpid
176.0 KiB +  47.0 KiB = 223.0 KiB       swapspace
184.0 KiB +  51.0 KiB = 235.0 KiB       atd
220.0 KiB +  57.0 KiB = 277.0 KiB       rpc.idmapd
304.0 KiB +  62.0 KiB = 366.0 KiB       irqbalance
312.0 KiB +  64.0 KiB = 376.0 KiB       sftp-server
308.0 KiB +  89.0 KiB = 397.0 KiB       rpcbind
300.0 KiB + 104.5 KiB = 404.5 KiB       cron
368.0 KiB +  99.0 KiB = 467.0 KiB       upstart-socket-bridge
560.0 KiB + 180.0 KiB = 740.0 KiB       systemd-logind
724.0 KiB +  93.0 KiB = 817.0 KiB       dbus-daemon
720.0 KiB + 136.0 KiB = 856.0 KiB       systemd-udevd
912.0 KiB + 118.5 KiB =   1.0 MiB       upstart-udev-bridge
920.0 KiB + 180.0 KiB =   1.1 MiB       rpc.statd (2)
  1.0 MiB + 129.5 KiB =   1.1 MiB       screen
  1.1 MiB +  84.5 KiB =   1.2 MiB       upstart-file-bridge
960.0 KiB + 452.0 KiB =   1.4 MiB       getty (6)
  1.6 MiB + 143.0 KiB =   1.7 MiB       init
  5.1 MiB +   1.5 MiB =   6.5 MiB       bash (3)
  5.7 MiB +   5.2 MiB =  10.9 MiB       sshd (8)
 11.7 MiB + 322.0 KiB =  12.0 MiB       glusterd
 27.3 MiB +  99.0 KiB =  27.4 MiB       rsyslogd
 67.4 MiB + 453.0 KiB =  67.8 MiB       glusterfsd (2)
---------------------------------
                        137.4 MiB
=================================

19568MiB - 137.4MiB ≈ 19431MiB RAM yang tidak terhitung

Penjelasan

The 120MiBbuffer dan cache digunakan bahwa Anda melihat dalam cerita di atas akun untuk perilaku efisien kernel dari caching data yang dikirim atau diterima dari perangkat eksternal.

Baris pertama, berlabel Mem , menampilkan pemanfaatan memori fisik, termasuk jumlah memori yang dialokasikan untuk buffer dan cache. Buffer, juga disebut buffer memory , biasanya didefinisikan sebagai bagian dari memori yang disisihkan sebagai tempat penyimpanan sementara untuk data yang dikirim ke atau diterima dari perangkat eksternal, seperti HDD, keyboard, printer atau jaringan.

Baris kedua data, yang dimulai dengan - / + buffer / cache , menunjukkan jumlah memori fisik yang saat ini digunakan untuk cache buffer sistem . Ini sangat berarti sehubungan dengan program aplikasi, karena semua data diakses dari file pada sistem yang dilakukan melalui penggunaan read () dan write () system calls melewati cache ini. Cache ini dapat sangat mempercepat akses ke data dengan mengurangi atau menghilangkan kebutuhan untuk membaca atau menulis ke HDD atau disk lain.

Sumber: http://www.linfo.org/free.html

Sekarang bagaimana kita menjelaskan yang hilang 19431MiB?

Pada free -moutput di atas, 19688MiB" used " in " - / + buffer / cache " berasal dari rumus ini:

(kb_main_used) - (buffers_plus_cached) =
(kb_main_total - kb_main_free) - (kb_main_buffers + kb_main_cached)

kb_main_total:   MemTotal from /proc/meminfo
kb_main_free:    MemFree  from /proc/meminfo
kb_main_buffers: Buffers  from /proc/meminfo
kb_main_cached:  Cached   from /proc/meminfo

Sumber: procps / free.c dan procps / proc / sysinfo.c

(Jika Anda melakukan nomor berdasarkan saya free -moutput, Anda akan melihat bahwa 2MiBtidak menyumbang, tapi itu karena dari kesalahan pembulatan diperkenalkan oleh kode ini: #define S(X) ( ((unsigned long long)(X) << 10) >> shift))

Angka-angka tidak bertambah /proc/meminfo, juga (saya tidak merekam /proc/meminfoketika saya berlari free -m, tetapi kita dapat melihat dari pertanyaan Anda yang /proc/meminfotidak menunjukkan di mana RAM yang hilang), jadi kami dapat menyimpulkan dari atas bahwa /proc/meminfotidak ceritakan keseluruhan cerita.

Dalam kondisi pengujian saya, saya tahu sebagai kontrol bahwa ZFS di Linux bertanggung jawab atas penggunaan RAM yang tinggi. Saya memberi tahu ARC-nya bahwa ia bisa menggunakan 16GiBRAM server.

ZFS di Linux bukanlah suatu proses. Ini adalah modul kernel.

Dari apa yang saya temukan sejauh ini, penggunaan RAM modul kernel tidak akan muncul menggunakan alat informasi proses karena modul ini bukan proses.

Penyelesaian masalah

Sayangnya, saya tidak cukup tahu tentang Linux untuk menawarkan Anda cara membuat daftar berapa banyak komponen non-proses RAM (seperti kernel dan modul-modulnya) gunakan.

Pada titik ini, kita dapat berspekulasi, menebak, dan memeriksa.

Anda memberikan dmesgoutput. Modul kernel yang dirancang dengan baik akan mencatat beberapa detailnya dmesg.

Setelah melihat-lihat dmesg, satu item menonjol bagi saya:FS-Cache

FS-Cacheadalah bagian dari cachefilesmodul kernel dan berkaitan dengan paket cachefilesddi Debian dan Red Hat Enterprise Linux.

Mungkin beberapa waktu yang lalu, Anda mengkonfigurasi FS-Cachepada disk RAM untuk mengurangi dampak I / O jaringan karena server Anda menganalisis data video.

Coba nonaktifkan modul kernel yang mencurigakan yang mungkin menghabiskan RAM. Mereka mungkin dapat dinonaktifkan dengan blacklistdi /etc/modprobe.d/, diikuti oleh sudo update-initramfs -u(perintah dan lokasi dapat berbeda menurut distribusi Linux).

Kesimpulan

Kebocoran memori memakan 8MB/hrRAM Anda dan tidak akan melepaskan RAM, sepertinya apa pun yang Anda lakukan. Saya tidak dapat menentukan sumber kebocoran memori Anda berdasarkan informasi yang Anda berikan, saya juga tidak dapat menawarkan cara untuk menemukan kebocoran memori tersebut.

Seseorang yang lebih berpengalaman dengan Linux daripada saya harus memberikan masukan tentang bagaimana kita dapat menentukan kemana perginya penggunaan "lain" RAM.

Saya telah memulai hadiah untuk pertanyaan ini untuk melihat apakah kita bisa mendapatkan jawaban yang lebih baik daripada "berspekulasi, tebak, dan periksa".

Deltik
sumber
Terima kasih untuk itu dan terima kasih untuk hadiahnya! Sekedar catatan, saya tidak mengaktifkan caching, aliran video dianalisis langsung dan tidak ada penyimpanan jaringan sama sekali (tidak ada NFS, tidak ada SMB, FS_Cache tidak digunakan dan saya tidak memiliki cachefilesd diinstal). Saya mencoba melihat semua modul kernel yang dimuat dan membongkar apa pun yang sudah tidak terpakai yang juga tidak membantu :( - Saya menduga mungkin ada kebocoran pada driver jaringan atau sesuatu - tapi saya kira pertanyaan saya dan pertanyaan Anda adalah bagaimana memecahkan masalah ini di luar dugaan .
Hackeron
1

Apakah Anda mengubah Swapiness Kernel Anda secara manual atau menonaktifkannya?

Anda dapat memberi Anda level tingkat swappyness saat ini

cat /proc/sys/vm/swappiness

Anda bisa mencoba memaksa kernel Anda untuk bertukar secara agresif

sudo sysctl -w vm.swappiness=100

jika ini mengurangi masalah Anda, temukan nilai yang baik antara 1 dan 100, sesuaikan dengan kebutuhan Anda.

chris
sumber
swappiness tidak ada hubungannya dengan itu - bahkan jika saya mematikan swap sepenuhnya, saya masih memiliki situasi di mana saya telah membunuh setiap proses pengguna dan masih semua memori habis.
Hackeron
-2

Anda tidak benar - ya perintah free -m Anda menunjukkan 220MB gratis tetapi juga menunjukkan bahwa 1771MB digunakan sebagai buffer. Buffer dan Cached adalah memori yang digunakan oleh kernel untuk mengoptimalkan akses ke data akses lambat, biasanya disk. Jadi Anda harus mempertimbangkan semua memori yang ditandai sebagai buffer sebagai memori bebas karena kernel dapat mengembalikannya kapan pun diperlukan.

Lihat: /server/23433/in-linux-what-is-the-ddference-between-buffers-and-cache-dilaporkan-by-the-f

Paul
sumber
Saya memperbarui jawaban untuk memperhitungkan ini. Saya minta maaf untuk mengatakan Anda pada dasarnya salah memahami keluaran dari perintah "bebas".
Hackeron