Ingin tahu apa artinya bagan analisis plot kacang ini

11

Bagaimana seseorang menginterpretasikan dan menghasilkan bagan plot kacang. Berikut adalah satu contoh yang diambil dari Walkes et al. 2010 . Jenis data apa yang paling berguna untuk ini?

plot kacang
(sumber: biomedcentral.com )

data-visualization boxplot Vanson Samuel
sumber
3
"Beanplot adalah alternatif dari boxplot untuk perbandingan visual data univariat antar kelompok. Dalam beanplot, pengamatan individu ditampilkan sebagai garis kecil dalam plot sebaran satu dimensi. Selanjutnya, estimasi kepadatan distribusi terlihat. dan rata-rata ditampilkan. " Ekstrak diambil dari sini .
Bagi mereka yang tidak tahu: ini adalah kerabat dekat biola (vioplot).

Jawaban:

12

Boxplot benar-benar dirancang untuk data normal, atau setidaknya data unimodal. Beanplot menunjukkan kepada Anda kurva kepadatan aktual, yang lebih informatif.

Bentuknya adalah kerapatan, dan garis horizontal pendek mewakili setiap titik data. Ini menggabungkan yang terbaik dari plot kotak, plot kepadatan, dan plot karpet semua dalam satu dan sangat mudah dibaca.

Sayangnya, contoh yang Anda pilih memutuskan untuk menambahkan banyak garis yang lebih panjang yang mengacaukan grafik yang tidak dapat dikenali (untuk saya). [menggunting]

EDIT: Setelah bekerja dengan beanplot sedikit lebih, garis tebal lebih panjang adalah rata-rata (atau opsional median) untuk setiap kacang. Garis tipis yang lebih panjang adalah data, dengan semacam "susun" di mana garis yang lebih luas menunjukkan nilai duplikat yang lebih banyak. (Anda juga dapat men-jitter mereka, yang saya sukai, tetapi setidaknya kategori "normal" sudah memiliki kepadatan poin yang wajar sehingga jittering bisa memperburuk.)

Saya masih berpikir contoh yang Anda pilih agak berantakan, yang mungkin bisa dihapus dengan menggunakan jittering daripada menumpuk.

The kertas yang menggambarkan paket R untuk membuat plot kacang adalah membaca yang baik.

Wayne
sumber
3
+1 - membaca artikel plot kacang sekarang. Saya juga menyarankan kertas kerja oleh Hadley Wickham, 40 tahun boxplots . Itu melewati deskripsi berbagai plot dengan tujuan kurang lebih sama dengan plot kacang.
Andy W
1

Tanpa membaca keseluruhan makalahnya, pada dasarnya itu merupakan varian dari boxplot. Dengan demikian, Anda dapat menggunakannya di mana Anda seharusnya menggunakan boxplot, seperti membandingkan distribusi univariat dari beberapa grup. Ini menampilkan garis untuk setiap titik dan overlay perkiraan kepadatan kernel. Dari melihatnya, saya akan berpikir itu mungkin lebih informatif dengan sejumlah kecil data, tetapi terlalu berantakan dengan lebih banyak data. Rasanya tidak terlalu mengguncang Bumi bagi saya, pada awalnya memerah. Jika Anda ingin tahu lebih banyak, jelaskan pertanyaan Anda.

gung - Pasang kembali Monica
sumber