Saya mencari contoh kode sederhana tentang cara menjalankan Partikel Filter di R. Paket pomp tampaknya mendukung bit matematika ruang keadaan, tetapi contoh-contoh agak sulit untuk mengikuti secara pemrograman untuk pengembang OO sederhana seperti saya, khususnya cara memuat data yang diamati ke dalam objek pomp.
Katakanlah saya memiliki file csv dengan 1 kolom data berisik sebagai input, dan saya ingin menjalankannya melalui Filter Partikel agar mudah dibersihkan, dengan output sebagai estimasi, ke file csv lainnya.
y <- read.csv("C:/Dev/VeryCleverStatArb/inputData.csv", header=FALSE)
#CSV to Pomp object ???
#Run Particle Filter
#Write estimates to csv.
Kesulitan utama dengan contoh-contoh adalah memuat data csv ke objek pomp.
Model ruang keadaan yang sangat sederhana harus cukup baik untuk saat ini.
Ada ide untuk R-penasaran?
Jawaban:
EDIT: Tampaknya sebagian besar paket filter partikel hilang sekarang. Namun, saya telah bermain dengan LaplacesDemon (paket MCMC Bayesian) dan memiliki fungsi PMC (Population Monte Carlo) yang mengimplementasikan PMC, yang merupakan jenis filter partikel. Mungkin terlalu banyak mesin untuk jenis filter partikel cepat, tetapi sebuah paket layak dipelajari.
Anda dapat menemukan paket dan tutorial di CRAN .
ASLI: Sejujurnya, dalam kasus paling sederhana,
pomp
sulit digunakan. Ini sangat fleksibel untuk apa pun yang Anda mungkin ingin lakukan, tetapi itu seperti menggunakan kapal ruang angkasa untuk pergi ke toko kelontong.Sudahkah Anda mencoba melihat filter Kalman (jika data Anda memenuhi asumsi filter Kalman), termasuk fungsi dasar
tsSmooth
danStructTS
(hanya univariat), dan paketdlm
? Saya juga akan melihatloess
dan smoothers lainnya.Saya harap saya salah dan seseorang melompat ke sini dengan cepat, "Inilah cara melakukannya untuk data univariat sederhana seperti yang Anda miliki dengan beberapa asumsi sederhana." Saya ingin bisa menggunakan paket sendiri.
sumber