Paket R untuk menggabungkan nilai-p menggunakan metode Fisher atau Stouffer

10

Apakah ada paket R (atau bahkan fungsi R dasar) yang mengimplementasikan metode Fisher atau Stouffer untuk menggabungkan nilai-p? Pengkodean ini seharusnya hampir sepele, tetapi saya lebih suka menggunakan (dan mengutip) sebuah paket.

Contoh kode dalam pertanyaan ini: Metode Fisher untuk menyisir nilai-p - bagaimana dengan ekor bawah?

r combining-p-values krlmlr
sumber

8

The metappaket oleh Michael Dewey mengimplementasikan banyak metode untuk menggabungkan p-nilai:

sumlog: Metode Fisher
sumz: Sepertinya metode Stouffer (dengan bobot), ini tidak disebutkan secara eksplisit dalam dokumentasi fungsi tetapi dikonfirmasi dalam sketsa sketsa (yang belum menjadi bagian dari paket)
meanp: Saat menggabungkan nilai-p, mengapa tidak hanya rata-rata?
...

krlmlr
sumber

Sketsa sekarang dalam paket terdistribusi.

mdewey

3

Ada juga combine.testfungsi dalam survcomppaket (pada Bioconductor). Menerapkan metode Fisher dan Stouffer, serta metode logit.

krlmlr
sumber

survcompjuga bekerja dalam kasus tepi dari nilai tunggal, menangani nilai yang hilang lebih konsisten dengan basis r dan mendorong kontribusi dengan memberikan repo resmi.

jan-glx

Paket R untuk menggabungkan nilai-p menggunakan metode Fisher atau Stouffer

Jawaban: