Pertanyaan apa yang akan diajukan ahli statistik tentang analisis wabah E. coli?

Anda mungkin pernah mendengar tentang wabah E. coli ( EHEC ) enterohaemorrhagic baru-baru ini di Jerman .
Pertanyaan apa yang akan diajukan ahli statistik tentang analisis EHEC?
Saya sedang memikirkan Q + As antara wartawan / pejabat publik ↔ non-ahli, katakanlah guru dan insinyur dengan gelar Diplom / Master tetapi paling tidak segelintir statistik.

(Apakah gambar, peta tanah EHEC yang menunjukkan berbagai galur EHEC dan cakupan berbagai tes, mungkin?)

Senin 20 Juni: Saya pikir wabah EHEC akan menjadi area di mana statistik benar-benar penting di dunia pada umumnya: apa bukti untuk berbagai penyebab, bagaimana ini bisa dikomunikasikan kepada publik? Jadi, memulai karunia.

data-visualization teaching denis
sumber

Saya tidak yakin apakah itu harus komunitas wiki karena saya pikir suara pada jawaban yang baik harus diperhitungkan untuk perwakilan, dan ada kemungkinan Anda akan mendapatkan jawaban yang lebih baik jika memang demikian.

Jeromy Anglim

Jawaban:

Jika Anda tidak memiliki pertanyaan ilmiah apriori yang Anda inginkan / perlu dijawab - saya akan melihat distribusi spasial kasus. Secara khusus, saya akan memperkirakan semacam fungsi "intensitas" spasial - yaitu beberapa fungsi . Agar Anda tidak menyesuaikan data, beberapa penghalusan akan sesuai, yang secara efektif akan "bin" lokasi terdekat bersama-sama. Pendekatan paling sederhana akan menggunakan fungsi estimasi kepadatan kernel (misalnya fungsi kde2d di R, meskipun beberapa pra-pemrosesan data mungkin diperlukan). Ini akan membantu mengidentifikasi "hot spot" dalam distribusi spasial dan dapat mengarahkan seorang penyelidik untuk mengidentifikasi reservoir lingkungan E. Coli. $f( {\bf s} ) = E({\rm prevalence} | {\rm \ you \ are \ in \ location \ } {\bf s} )$

Bergantung pada data apa yang Anda miliki, model spasial yang lebih canggih yang menyesuaikan pembaur yang diketahui dapat digunakan.

Makro
sumber

Mendiagnosis varian EHEC dan kemungkinan sumbernya tampaknya sulit, rapuh. Seperti yang Anda tahu, para pejabat Jerman pertama-tama mengatakan "itu mentimun dari Spanyol", kemudian berminggu-minggu kemudian "itu pasti kecambah" (biji, air ...?) (Saya menyadari bahwa banyak orang menginginkan jawaban instan, dan dilayani satu.) Dengan gejala yang jelas, peta dapat menyebabkan suatu penyebab, seperti pada peta terkenal wabah kolera di London pada tahun 1854 . Tapi peta wabah EHEC ?

denis