Sebelum memposting pertanyaan ini, saya telah menelusuri pertanyaan-pertanyaan lain di Stack ini, dan ini mungkin akan menjadi jalan-jalan di taman untuk siapa saja yang membacanya! Tetapi deskripsi Stack ini termasuk analisis dan visualisasi data, jadi saya harap ini ada di tempat yang tepat!
</preapology>
Saya menggunakan Raspberry Pi dengan magnet dan sensor buluh untuk merekam apa yang hamster saya bangun di malam hari. Pi mencatat setiap rotasi sebagai berikut:
2014-09-04 00:20:04.987819,1
2014-09-04 00:20:16.219891,2
2014-09-04 00:20:17.260086,3
2014-09-04 00:20:20.031204,4
2014-09-04 00:20:20.907755,5
...
Saat melakukan sesuatu dengan data itulah saya perlu bantuan. Berikut adalah contoh analisis harian yang dihasilkan Pi:
Halo ayah!
Tadi malam, saya naik setir saya pukul 00.20 dan pergi tidur jam 04:51 (tentu saja dengan istirahat!). Istirahat terlama saya dari kemudi adalah selama 26 menit mulai 03:05 - 03:31.
Selama 4 jam dan 31 menit, saya memutar setir 11.903 kali! Karena rodanya berdiameter 18cm, ini berarti saya menempuh jarak 18π⋅11903 / 100 ≈ 6.731 meter. Itu 4,18 mil!
Biskuit Cinta x
Saya juga telah menghasilkan grafik sederhana dari data, yang terlihat sebagai berikut:
Saya juga berpikir untuk melakukan gangguan per jam untuk melihat waktu mana dia paling aktif.
Mengingat pengetahuan statistik saya yang tidak ada, hanya itu yang bisa saya pikirkan. Apakah ada hal lain yang bisa saya lakukan? (Dalam hal analisis dan visualisasi). Jika perlu menangkap data tambahan, itu tidak masalah.
Diedit untuk menunjukkan awal pelacakan actigraphy
sumber
Jawaban:
Dalam pengaturan laboratorium ini sangat sering dilakukan untuk mempelajari ritme sirkadian (yaitu ~ 24 jam).
Jika Anda dapat merekam aktivitas untuk jangka waktu yang lama (misalnya beberapa hari), Anda dapat melakukan beberapa analisis periodisitas.
Representasi biasa dari tipe data ini adalah actogram, yang juga memungkinkan Anda untuk melihat apakah ada perbedaan sehari-hari.
Dalam contoh ini setelah hari ke 8 mouse diletakkan dalam kegelapan konstan dan, seperti yang Anda lihat, meskipun ritme selalu ada, lebih pendek mengungkapkan apa yang biasanya disebut "ritme berlari bebas".
Perhatikan bahwa gambar ini sangat bersih. Terkadang Anda memiliki aktivitas di siang hari!
Dari: Mengukur Respons Cahaya Circadian dan Acute pada Tikus menggunakan Wheel Running Activity - LeGates dan Altimus, JOVE 2011
Makalah ini memberikan pengantar yang bagus tentang bagaimana menganalisis data roda-lari:
Sebuah pedoman untuk menganalisis perilaku menjalankan roda sirkadian pada tikus di bawah kondisi pencahayaan yang berbeda - Jud et al. Prosedur Biol Online. 2005
Anda juga dapat melakukan beberapa analisis frekuensi, misalnya menggunakan chi-square periodogram.
Lihat: The chi square periodogram: kegunaannya untuk analisis ritme sirkadian. - Sokolove dan Bushell, J Theor Biol. 1978 (maaf, di balik dinding bayar, tetapi lihat juga referensi di sini )
Satu hal yang dapat Anda lakukan adalah melihat apakah ritme ini berubah selama seminggu. Misalnya, saya menganggap Anda bangun nanti (dan membuat lebih sedikit suara) selama akhir pekan.
Apakah itu memengaruhi aktivitas ujung roda?
Apakah ritme berubah antara musim panas dan musim dingin?
Juga, jika Anda menghubungkan kamera ke sistem, Anda dapat melakukan beberapa pelacakan gerakan. Berikut adalah contoh "pelacakan hamster" menggunakan Python dan OpenCV .
sumber
Pertanyaan apa yang akan Anda tanyakan tentang data?
Semua ini akan menyarankan berbagai jenis plot. Agregat waktu di atas roda demi hari, plot lebih dari beberapa hari.
Lihat http://journal.r-project.org/archive/2013-1/hofmann-unwin-cook.pdf untuk cara memplot data dengan cara berbeda untuk mengeksplorasi hal yang berbeda, jawab pertanyaan yang berbeda. Satu plot hampir tidak pernah cukup.
sumber