Apakah Python SciPy membutuhkan BLAS?

numpy.distutils.system_info.BlasNotFoundError: 
    Blas (http://www.netlib.org/blas/) libraries not found.
    Directories to search for the libraries can be specified in the
    numpy/distutils/site.cfg file (section [blas]) or by setting
    the BLAS environment variable.

Tar mana yang harus saya unduh dari situs ini?

Saya sudah mencoba fortrans, tetapi saya terus mendapatkan kesalahan ini (setelah menetapkan variabel lingkungan jelas).

Halaman web SciPy digunakan untuk memberikan instruksi pembangunan dan instalasi, tetapi instruksi di sana sekarang bergantung pada distribusi biner OS. Untuk membangun SciPy (dan NumPy) pada sistem operasi tanpa paket yang telah dikompilasi dari pustaka yang diperlukan, Anda harus membuat dan kemudian secara statis menautkan ke pustaka Fortran BLAS dan LAPACK :

mkdir -p ~/src/
cd ~/src/
wget http://www.netlib.org/blas/blas.tgz
tar xzf blas.tgz
cd BLAS-*

## NOTE: The selected Fortran compiler must be consistent for BLAS, LAPACK, NumPy, and SciPy.
## For GNU compiler on 32-bit systems:
#g77 -O2 -fno-second-underscore -c *.f                     # with g77
#gfortran -O2 -std=legacy -fno-second-underscore -c *.f    # with gfortran
## OR for GNU compiler on 64-bit systems:
#g77 -O3 -m64 -fno-second-underscore -fPIC -c *.f                     # with g77
gfortran -O3 -std=legacy -m64 -fno-second-underscore -fPIC -c *.f    # with gfortran
## OR for Intel compiler:
#ifort -FI -w90 -w95 -cm -O3 -unroll -c *.f

# Continue below irrespective of compiler:
ar r libfblas.a *.o
ranlib libfblas.a
rm -rf *.o
export BLAS=~/src/BLAS-*/libfblas.a

Jalankan hanya satu dari lima perintah g77 / gfortran / ifort. Saya sudah berkomentar semua, tapi gfortran yang saya gunakan. Instalasi LAPACK selanjutnya membutuhkan kompiler Fortran 90 , dan karena kedua pemasangan harus menggunakan kompiler Fortran yang sama, G77 tidak boleh digunakan untuk BLAS.

Selanjutnya, Anda harus menginstal barang-barang LAPACK. Petunjuk halaman web SciPy juga membantu saya di sini, tetapi saya harus memodifikasinya agar sesuai dengan lingkungan saya:

mkdir -p ~/src
cd ~/src/
wget http://www.netlib.org/lapack/lapack.tgz
tar xzf lapack.tgz
cd lapack-*/
cp INSTALL/make.inc.gfortran make.inc          # On Linux with lapack-3.2.1 or newer
make lapacklib
make clean
export LAPACK=~/src/lapack-*/liblapack.a

Pembaruan pada 3-Sep-2015: Terverifikasi beberapa komentar hari ini (terima kasih untuk semua): Sebelum menjalankan make lapacklibedit make.incfile dan tambahkan -fPICopsi ke OPTSdan NOOPTpengaturan. Jika Anda menggunakan arsitektur 64bit atau ingin mengompilasinya, tambahkan juga -m64. Adalah penting bahwa BLAS dan LAPACK dikompilasi dengan opsi-opsi ini diatur ke nilai yang sama. Jika Anda lupa -fPICSciPy benar-benar akan memberi Anda kesalahan tentang simbol yang hilang dan akan merekomendasikan switch ini. Bagian spesifik make.inctampilannya seperti ini di pengaturan saya:

FORTRAN  = gfortran 
OPTS     = -O2 -frecursive -fPIC -m64
DRVOPTS  = $(OPTS)
NOOPT    = -O0 -frecursive -fPIC -m64
LOADER   = gfortran

Pada mesin lama (mis. RedHat 5), gfortran mungkin diinstal dalam versi yang lebih lama (misal 4.1.2) dan tidak mengerti opsi -frecursive. Cukup hapus dari make.incfile dalam kasus seperti itu.

Target uji lapack dari Makefile gagal dalam pengaturan saya karena tidak dapat menemukan perpustakaan blas. Jika Anda teliti, Anda dapat memindahkan pustaka blas untuk sementara waktu ke lokasi yang ditentukan untuk menguji lapack. Saya orang yang malas, jadi saya percaya para devs membuatnya bekerja dan memverifikasi hanya di SciPy.

Jika Anda perlu menggunakan versi SciPy terbaru daripada versi paket, tanpa melalui kerumitan membangun BLAS dan LAPACK, Anda dapat mengikuti prosedur di bawah ini.

Instal pustaka aljabar linier dari repositori (untuk Ubuntu),

sudo apt-get install gfortran libopenblas-dev liblapack-dev

Kemudian instal SciPy, (setelah mengunduh sumber SciPy): python setup.py installatau

pip install scipy

Seperti halnya mungkin.

Di Fedora, ini berfungsi:

 yum install lapack lapack-devel blas blas-devel
 pip install numpy
 pip install scipy

Jangan lupa untuk menginstal ' lapack-devel ' dan ' blas-devel ' selain 'blas' dan 'lapack' jika tidak, Anda akan mendapatkan kesalahan yang Anda sebutkan atau kesalahan "numpy.distutils.system_info. LapackNotFoundError ".

Saya kira Anda berbicara tentang instalasi di Ubuntu. Cukup gunakan:

apt-get install python-numpy python-scipy

Itu harus mengurus kompilasi perpustakaan BLAS juga. Lain, kompilasi perpustakaan BLAS sangat sulit.

Untuk pengguna Windows ada paket biner yang bagus dari Chris (peringatan: ini adalah unduhan yang cukup besar, 191 MB):

• http://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/#scipy-stack

Mengikuti instruksi yang diberikan oleh 'cfi' bekerja untuk saya, meskipun ada beberapa bagian yang mereka butuhkan:

1) Direktori lapack Anda, setelah unzipping, dapat disebut lapack-XY (beberapa nomor versi), jadi Anda bisa mengganti nama itu menjadi LAPACK.

cd ~/src
mv lapack-[tab] LAPACK

2) Dalam direktori itu, Anda mungkin perlu melakukan:

cd ~/src/LAPACK 
cp lapack_LINUX.a libflapack.a

Coba gunakan

sudo apt-get install python3-scipy