Iterasi di atas larik numpy

136

Apakah ada alternatif yang tidak terlalu bertele-tele untuk ini:

for x in xrange(array.shape[0]):
    for y in xrange(array.shape[1]):
        do_stuff(x, y)

Saya datang dengan ini:

for x, y in itertools.product(map(xrange, array.shape)):
    do_stuff(x, y)

Yang menghemat satu lekukan, tetapi masih cukup jelek.

Saya mengharapkan sesuatu yang terlihat seperti pseudocode ini:

for x, y in array.indices:
    do_stuff(x, y)

Apakah yang seperti itu ada?

Ram Rachum
sumber
Saya menggunakan python 2.7 dan saya menggunakan solusi Anda dengan itertools; saya membaca di komentar bahwa menggunakan itertools akan lebih cepat. Namun, (mungkin karena saya di 2.7) saya juga harus membongkar peta di loop for. for x, y in itertools.product(*map(xrange, array.shape)):
ALM
Ada halaman di Referensi NumPy yang disebut "Iterating Over Arays
Casey
terkait: stackoverflow.com/questions/29493183/…
Eulenfuchswiesel

Jawaban:

188

Saya pikir Anda sedang mencari ndenumerate .

>>> a =numpy.array([[1,2],[3,4],[5,6]])
>>> for (x,y), value in numpy.ndenumerate(a):
...  print x,y
... 
0 0
0 1
1 0
1 1
2 0
2 1

Mengenai kinerjanya. Ini sedikit lebih lambat daripada pemahaman daftar.

X = np.zeros((100, 100, 100))

%timeit list([((i,j,k), X[i,j,k]) for i in range(X.shape[0]) for j in range(X.shape[1]) for k in range(X.shape[2])])
1 loop, best of 3: 376 ms per loop

%timeit list(np.ndenumerate(X))
1 loop, best of 3: 570 ms per loop

Jika Anda khawatir tentang kinerja, Anda dapat mengoptimalkan sedikit lebih jauh dengan melihat implementasi dari ndenumerate, yang melakukan 2 hal, mengonversi ke array dan perulangan. Jika Anda tahu Anda memiliki sebuah array, Anda dapat memanggil .coordsatribut iterator datar.

a = X.flat
%timeit list([(a.coords, x) for x in a.flat])
1 loop, best of 3: 305 ms per loop
SiggyF
sumber
1
Perhatikan bahwa ini berfungsi tetapi sangat lambat. Anda lebih baik mengulanginya secara manual.
Marty
45

Jika Anda hanya membutuhkan indeks, Anda dapat mencoba numpy.ndindex:

>>> a = numpy.arange(9).reshape(3, 3)
>>> [(x, y) for x, y in numpy.ndindex(a.shape)]
[(0, 0), (0, 1), (0, 2), (1, 0), (1, 1), (1, 2), (2, 0), (2, 1), (2, 2)]
pengirim
sumber
15

lihat nditer

import numpy as np
Y = np.array([3,4,5,6])
for y in np.nditer(Y, op_flags=['readwrite']):
    y += 3

Y == np.array([6, 7, 8, 9])

y = 3tidak akan bekerja, menggunakan y *= 0dan y += 3sebagai gantinya.

C19
sumber
2
atau gunakan y [...] = 3
Donald Hobson