Kolom binning dengan python pandas

102

Saya memiliki kolom Data Frame dengan nilai numerik:

df['percentage'].head()
46.5
44.2
100.0
42.12

Saya ingin melihat kolom sebagai jumlah bin:

bins = [0, 1, 5, 10, 25, 50, 100]

Bagaimana saya bisa mendapatkan hasil sebagai bin dengan mereka value counts?

[0, 1] bin amount
[1, 5] etc 
[5, 10] etc 
......
Pejalan Malam
sumber

Jawaban:

192

Anda dapat menggunakan pandas.cut:

bins = [0, 1, 5, 10, 25, 50, 100]
df['binned'] = pd.cut(df['percentage'], bins)
print (df)
   percentage     binned
0       46.50   (25, 50]
1       44.20   (25, 50]
2      100.00  (50, 100]
3       42.12   (25, 50]

bins = [0, 1, 5, 10, 25, 50, 100]
labels = [1,2,3,4,5,6]
df['binned'] = pd.cut(df['percentage'], bins=bins, labels=labels)
print (df)
   percentage binned
0       46.50      5
1       44.20      5
2      100.00      6
3       42.12      5

Atau numpy.searchsorted:

bins = [0, 1, 5, 10, 25, 50, 100]
df['binned'] = np.searchsorted(bins, df['percentage'].values)
print (df)
   percentage  binned
0       46.50       5
1       44.20       5
2      100.00       6
3       42.12       5

... dan kemudian value_countsatau groupbydan agregat size:

s = pd.cut(df['percentage'], bins=bins).value_counts()
print (s)
(25, 50]     3
(50, 100]    1
(10, 25]     0
(5, 10]      0
(1, 5]       0
(0, 1]       0
Name: percentage, dtype: int64

s = df.groupby(pd.cut(df['percentage'], bins=bins)).size()
print (s)
percentage
(0, 1]       0
(1, 5]       0
(5, 10]      0
(10, 25]     0
(25, 50]     3
(50, 100]    1
dtype: int64

Secara default cutkembali categorical.

Seriesmetode like Series.value_counts()akan menggunakan semua kategori, bahkan jika beberapa kategori tidak ada dalam data, operasi dalam kategori .

jezrael
sumber
tanpa bins = [0, 1, 5, 10, 25, 50, 100], dapatkah saya mengatakan buat 5 tempat sampah dan itu akan memotongnya dengan pemotongan rata-rata? misalnya, saya punya 110 record, saya ingin memotongnya menjadi 5 bin dengan 22 record di setiap bin.
qqqwww
2
@qqqwww - TIDAK yakin jika mengerti, menurut Anda qcut? tautan
jezrael
@qqqwww untuk melakukan itu, contoh pd.cut di halamannya menunjukkannya: pd.cut (np.array ([1, 7, 5, 4, 6, 3]), 3) akan memotong array menjadi 3 bagian yang sama.
Ayan Mitra
@jezreal dapatkah Anda menyarankan cara menghitung rata-rata setiap bin juga?
Ayan Mitra
1
@AyanMitra - Apakah menurut Anda df.groupby(pd.cut(df['percentage'], bins=bins)).mean()?
jezrael
5

Menggunakan numbamodul untuk mempercepat.

Pada kumpulan data besar ( 500k >) pd.cutbisa menjadi sangat lambat untuk binning data.

Saya menulis fungsi saya sendiri numbahanya dengan kompilasi waktu, yang kira-kira 16xlebih cepat:

from numba import njit

@njit
def cut(arr):
    bins = np.empty(arr.shape[0])
    for idx, x in enumerate(arr):
        if (x >= 0) & (x < 1):
            bins[idx] = 1
        elif (x >= 1) & (x < 5):
            bins[idx] = 2
        elif (x >= 5) & (x < 10):
            bins[idx] = 3
        elif (x >= 10) & (x < 25):
            bins[idx] = 4
        elif (x >= 25) & (x < 50):
            bins[idx] = 5
        elif (x >= 50) & (x < 100):
            bins[idx] = 6
        else:
            bins[idx] = 7

    return bins
cut(df['percentage'].to_numpy())

# array([5., 5., 7., 5.])

Opsional: Anda juga dapat memetakannya ke tempat sampah sebagai string:

a = cut(df['percentage'].to_numpy())

conversion_dict = {1: 'bin1',
                   2: 'bin2',
                   3: 'bin3',
                   4: 'bin4',
                   5: 'bin5',
                   6: 'bin6',
                   7: 'bin7'}

bins = list(map(conversion_dict.get, a))

# ['bin5', 'bin5', 'bin7', 'bin5']

Perbandingan kecepatan :

# create dataframe of 8 million rows for testing
dfbig = pd.concat([df]*2000000, ignore_index=True)

dfbig.shape

# (8000000, 1)
%%timeit
cut(dfbig['percentage'].to_numpy())

# 38 ms ± 616 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 10 loops each)
%%timeit
bins = [0, 1, 5, 10, 25, 50, 100]
labels = [1,2,3,4,5,6]
pd.cut(dfbig['percentage'], bins=bins, labels=labels)

# 215 ms ± 9.76 ms per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 10 loops each)
Erfan
sumber