Saya telah melakukan percobaan untuk mempelajari respons ragi (yang mengandung 5.000 gen) terhadap stres akibat sengatan panas. Saya memiliki satu daftar 48 gen yang diekspresikan berlebih pada 37ºC dan daftar lain dari 145 gen yang diekspresikan berlebih pada 42ºC. Ada 38 gen yang diekspresikan berlebih di keduanya.
Secara kebetulan saya berharap hanya 1 gen yang diekspresikan berlebih di keduanya, bagaimana saya bisa menghitung jika tumpang tindih yang saya dapatkan secara signifikan? Bagaimana saya bisa mendapatkan nilai ? Saya tidak tahu apa-apa tentang perangkat lunak biostatistik atau matematika. Terima kasih banyak!!! Setiap bantuan akan sangat disambut :)
Jawaban:
Tabelnya terlihat seperti ini
ya dan tidak merujuk pada kasus-kasus yang diekspresikan berlebih atau tidak, saya menjalankan tes Fisher di SAS. Outputnya ditempelkan di bawah ini:
Anda lihat di sini bahwa nilai p untuk uji Fisher's Exact sangat kecil, jauh lebih kecil dari 0,0001.
Ini menunjukkan dengan tepat apa yang Anda nyatakan yang diamati yang diekspresikan berlebih pada kedua suhu jauh lebih besar daripada yang Anda harapkan di bawah kemandirian yang seperti yang Anda nyatakan 1.296.
sumber
Tes yang tepat disebut oleh Michael mungkin cara saya akan merekomendasikan menggunakan untuk menyelesaikan masalah (asumsi paling sedikit). Untuk referensi, uji statistik umum yang sesuai akan menjadi tes kemerdekaan .χ2
sumber