Gagasan untuk perangkat lunak "lab notebook"?

20

Jadi ini cocok aneh, meskipun sebenarnya saya pikir ini cocok aneh untuk situs mana pun, jadi saya pikir saya akan mencobanya di sini, di antara saudara-saudara saya yang data-crunching-nya.

Saya datang ke epidemiologi dan biostatistik dari biologi, dan masih memiliki kebiasaan dari bidang itu. Salah satunya adalah menyimpan buku catatan laboratorium. Ini berguna untuk mendokumentasikan pemikiran, keputusan, renungan tentang analisis, dll. Semua di satu tempat, semuanya berkomitmen sehingga saya dapat melihat kembali analisis nanti dan memiliki beberapa petunjuk tentang apa yang saya lakukan.

Tapi alangkah baiknya untuk memindahkan itu ke abad ke-21. Terutama karena meskipun sistem notebook lab cukup layak untuk satu orang dan mendokumentasikan keputusan, akan lebih baik untuk dapat melampirkan plot dari EDA, email dari manajer data yang membahas kumpulan data tertentu, dll.

Saya kira ini akan melibatkan pemasangan sistem saya sendiri dari penyatuan banyak bit yang berbeda, tetapi apakah ada yang saat ini menggunakan sistem dan memiliki rekomendasi?

Fomite
sumber
1
Saya pikir mungkin OK untuk kakek (yaitu, biarkan terbuka) utas ini.
gung - Reinstate Monica

Jawaban:

10

Ini disebut Electronic Lab Notebooks (ELN).

Berikut adalah beberapa opsi open source yang pernah saya lihat:

  1. The Sage Notebook .

  2. Notebook IPython baru , yang sekarang dapat dijalankan sebagai webapp di EC2 dan Azure.

  3. Leo, yang dapat digunakan dengan IPython dan banyak cara lainnya.

  4. Berbagai solusi wiki, blogging, dan CMS.

Ed Hagen
sumber
Saya akhirnya menggunakan wiki Wikispaces gratis sebagai pengganti notebook lab eksperimental saya saat ini.
Fomite
10

Favorit saya: Evernote . Anda dapat menandai entri (misalnya, 'analisis', 'ide', dll.), Anda dapat menempelkan gambar dan grafik, dan Anda dapat berbagi buku catatan dengan kolaborator. Dan: pada dasarnya gratis (yah, freemium). Tapi edisi gratisnya cukup memadai untukku.

Felix S
sumber
Selain itu, ada aplikasi gratis untuk Android dan iOS.
Jose Zubcoff
+1 Saya menemukan aplikasi seluler untuk Evernote sangat berguna ketika berlarian di antara laboratorium atau mencatat pikiran ketika jauh dari komputer.
jthetzel
2

Saya tidak pernah menggunakannya secara pribadi, tetapi Microsoft memiliki perangkat lunak di Office suite bernama OneNote yang mencapai tujuan yang mirip dengan spesifikasi notebook e-lab Anda. Lihat situs web mereka untuk informasi lebih lanjut. Mereka juga menawarkan uji coba gratis yang dibundel dengan MS Office di sini .

Christopher Aden
sumber
1
@ mbq apakah Anda sudah menemukan pengganti Linux yang layak untuk Onenote?
andreas-h
2

Saya menemukan Xmind berguna. Anda dapat melampirkan apa saja, dan struktur pohon sangat berguna untuk pengorganisasian. Saya terutama menyukai fitur di mana Anda dapat menelusuri ke dalam node (topik). Ada lebih banyak produk perangkat lunak serupa yang mengeksploitasi konsep yang sama.

mpiktas
sumber
2
Freeplane dan Freemind adalah dua alternatif gratis yang saya gunakan untuk berbagai proyek. Garpu baru FreeMind adalah SciPlore MindMappings, yang mencakup dukungan untuk referensi BibTeX dan mengimpor bookmark dari PDF.
Wayne
2

Secara pribadi saya telah menemukan Livescribe 'smartpen' yang dikirim Tuhan.

itu menggabungkan 'pesona dunia lama' yang dapat dipercaya dari sebuah pena dan kertas notebook tradisional tetapi mencakup kemampuan untuk merekam suara (yang disinkronkan dengan sapuan pena Anda) siap untuk revisi nanti. NB- ada kerugian dan itu adalah Anda harus membeli kertas khusus yang bekerja dengan pena ..... ayunan dan putaran-a-pertarungan benar-benar

Audio / pena memicu sebuah diunggah ke web dan kemudian dilampirkan ke banyak program lain yang sudah higlihted di atas.

Siswa yang saya ajar (biomekanik) sangat menyukai ini dan kemudian mempelajari konsep yang sulit jauh lebih mudah daripada sebelumnya (pra-tinggal)

Andrew V
sumber
1

Anda mungkin ingin melihat Zotero beta terbaru , yang sekarang berdiri sendiri dan tidak memerlukan Firefox.

Wayne
sumber
1
Zotero adalah manajer bibliografi, bukan ELN.
nico
1
@nico: Saya yakin Anda dapat menyimpan apa pun yang Anda inginkan di Zotero, termasuk dokumen Anda sendiri. Ini bukan ELN, tetapi gratis dan akan membuatnya mudah untuk memasukkan (dan mengindeks) materi lainnya juga.
Wayne
tentu, dan itu hebat bahwa Anda menyebutkannya (saya sering menggunakannya dan itu luar biasa), tetapi alternatif opensource lain yang secara khusus dianggap sebagai ELN ada, jadi mengapa tidak menggunakan itu?
nico
1

Lihat artikel ini, Mempercantik Data di Dunia Nyata , dari Precedings Alam untuk beberapa ide.

Charlie
sumber
2
itu adalah artikel yang bagus, tetapi akan membantu untuk merangkum beberapa informasi dalam jawaban Anda
Abe
Hai @ Ya, itu akan lebih membantu. Saya belum membaca artikel itu sendiri, baru menemukannya kemarin dan tidak terlalu tertarik dengan topik itu sendiri. Saya pikir saya akan tetap berbagi.
Charlie
0

Bagaimana dengan Dewan Boogie? Anda dapat menulis catatan Anda pada kertas tulis dan mencatatnya sebagai ide yang sama dengan pena LiveScribe tetapi Anda dapat menyimpannya sebagai file PDF ... Belum keluar, tetapi akan dalam waktu kurang dari sebulan.

Berk U.
sumber
Onesoftwares mengunduh firefox 57.0 Unduh gratis.
Noman Disukai