Analisis spasial dan pengelompokan fitur dekat

11

Saya bekerja pada perilaku menandai pada hewan hidup kelompok dan saya tertarik pada bagaimana perilaku menandai dipengaruhi oleh karakteristik tertentu dari kelompok tetangga. Saya telah merencanakan wilayah masing-masing kelompok dari 95% kepadatan isoplet yang dibuat menggunakan a-LoCoH. Tanda setiap individu dari suatu kelompok diplot sebagai lapisan poin yang terpisah. Perilaku menandai tampaknya tidak acak, dan mereka tampaknya mengelompok di sekitar batas dengan kelompok tetangga. Apa yang ingin saya selidiki apakah individu menandai lebih dekat beberapa kelompok daripada yang lain, misalnya, apakah individu menandai kurang dekat kelompok yang terkait erat? apakah mungkin untuk menunjukkan bahwa titik-titik berkumpul di dekat beberapa fitur tetapi tidak di dekat yang lain?

Setiap bantuan yang dapat diberikan akan sangat dihargai,

Dave Humphries

pembaruan #####

Untuk demonstrasi, di bawah ini adalah gambar empat wilayah (A, B, C, dan D) dan lokasi penandaan dua individu dari grup A. Grup A dan B saling terkait erat. Grup C dan D tidak terkait dengan grup A.

masukkan deskripsi gambar di sini

clustering Dave Humphries
sumber
1
Apakah Anda dapat menyediakan data sampel?
om_henners
Maaf, saya baru menumpuk pertukaran - dan GIS dalam hal ini, apa format standar untuk menyediakan data sampel? Dokumen ArcMap?
Dave Humphries
1
Data sampel harus dipublikasikan dalam format GIS terbuka yang dapat dibaca oleh banyak sistem GIS.
MarkusN
Beberapa file yang terlibat adalah shapefile dan seperti yang saya pahami saat ini tidak ada cara berbagi jenis file ini di SE. Saya senang memberikan contoh melalui email di: [email protected]
Dave Humphries
Pertanyaan lain ketika saya memikirkan hal ini (libur libur) - apakah batas a-LoCoH dihasilkan dari dataset penandaan yang sama, atau dataset yang berbeda sama sekali? Juga, jenis perangkat lunak apa yang Anda gunakan (dan apakah Anda memiliki akses)?
om_henners

Jawaban:

1

Saya sangat merekomendasikan untuk melihat R , khususnya paket spatstat dari CSRIO. Ada manual / tutorial yang sangat baik oleh Prof. Adrian Baddeley tersedia yang akan membawa Anda melalui sejumlah metode yang berbeda untuk analisis pola titik. Khususnya, saya akan melihat Bagian VII: Pola Titik Bertanda (khususnya fungsi korelasi Markus pada halaman 202). Catatan di sini merujuk pada data yang diklasifikasikan oleh atribut alih-alih memiliki hubungan numerik.

Ada juga bab tentang membaca data di (menggunakan rgdal , sp dll.) Di awal dokumen. Jika Anda menggunakan ArcGIS, saya akan melihat Lingkungan Pemodelan Geospasial sebagai salah satu cara untuk menghubungkan antara data dalam R dan ArcGIS, jika tidak QGIS memiliki manageR yang akan melakukan hal yang sama.

Terakhir @whuber (di antara banyak lainnya) di GIS SE memiliki sejumlah besar pengalaman dalam R, jadi ajukan pertanyaan saat Anda menemukannya atau coba dan tangkap dia dalam obrolan.

om_henners
sumber
Terima kasih banyak atas saran Anda. Saya akan mencoba paket spatstat dan melihat bagaimana saya pergi.
Dave Humphries